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Exploring Glycan Binding Specificity of Odorranalectin by Alanine Scanning Library

化学 等温滴定量热法 褐藻糖胶 岩藻糖 立体化学 凝集素 丙氨酸 聚糖 半乳糖 生物化学 糖肽 单糖 多糖 氨基酸 糖蛋白 抗生素
作者
YashoNandini Singh,Predrag Čudić,Mare Čudić
出处
期刊:European Journal of Organic Chemistry [Wiley]
卷期号:2022 (28) 被引量:2
标识
DOI:10.1002/ejoc.202200302
摘要

Fluorescently labelled alanine scan analogues of odorranalectin (OL), a cyclic peptide that exhibits lectin like properties, were screened for binding BSA-conjugated monosaccharides using an enzyme-linked lectin assay (ELLA). Results revealed that Lys5, Phe7, Tyr9, Gly12, Leu14, and Thr17 were crucial for binding BSA-L-fucose, BSA-D-galactose and BSA-N-acetyl-D-galactosamine. Notably, Ala substitution of Ser3, Pro4, and Val13 resulted in higher binding affinities compared to the native OL. The obtained data also indicated that Arg8 plays an important role in differentiation of binding for BSA-L-fucose/D-galactose from BSA-N-acetyl-D-galactosamine. The thermodynamics of binding of the selected alanine analogues was evaluated by isothermal titration calorimetry. Low to moderate binding affinities were determined for the tetravalent MUC1 glycopeptide and asialofetuin, respectively, and high for the fucose rich polysaccharide, fucoidan. The thermodynamic profile of interactions with asialofetuin exhibits shift to an entropy-driven mechanism compared to the fucoidan, which displayed an enthalpyentropy compensation, typically associated with the carbohydratelectin recognition process.
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