Genetic correlation, causal relationship, and shared loci between vitamin D and COVID‐19: A genome‐wide cross‐trait analysis

孟德尔随机化 全基因组关联研究 生物 维生素D与神经学 连锁不平衡 遗传学 数量性状位点 遗传关联 表达数量性状基因座 基因座(遗传学) 单核苷酸多态性 基因型 基因 内分泌学 遗传变异
作者
Shizheng Qiu,Kun Zheng,Yang Hu,Guiyou Liu
出处
期刊:Journal of Medical Virology [Wiley]
卷期号:95 (5) 被引量:7
标识
DOI:10.1002/jmv.28780
摘要

Abstract Observational studies have shown that vitamin D supplementation reduces the risk of COVID‐19 infection, yet little is known about the shared genomic architectures between them. Leveraging large‐scale genome‐wide association study (GWAS) summary statistics, we investigated the genetic correlation and causal relationship between genetically determined vitamin D and COVID‐19 using linkage disequilibrium score regression and Mendelian randomization (MR) analyses, and conducted a cross‐trait GWAS meta‐analysis to identify the overlapping susceptibility loci of them. We observed a significant genetic correlation between genetically predicted vitamin D and COVID‐19 ( r g = −0.143, p = 0.011), and the risk of COVID‐19 infection would decrease by 6% for every 0.76 nmol L −1 increase of serum 25 hydroxyvitamin D (25OHD) concentrations in generalized MR (OR = 0.94, 95% CI: 0.89–0.99, p = 0.019). We identified rs4971066 ( EFNA1 ) as a risk locus for the joint phenotype of vitamin D and COVID‐19. In conclusion, genetically determined vitamin D is associated with COVID‐19. Increased levels of serum 25OHD concentration may benefit the prevention and treatment of COVID‐19.
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