pmoA Primers for Detection of Anaerobic Methanotrophs

甲烷厌氧氧化 生物 细菌 念珠菌 无氧运动 亚硝酸盐 环境化学 基因组 聚合酶链反应 甲烷 微生物学 基因 化学 生态学 生物化学 16S核糖体RNA 遗传学 生理学 硝酸盐
作者
Francisca A. Luesken,Baoli Zhu,Theo A. van Alen,Margaret K. Butler,Marina. Rodriguez Diaz,Bongkeun Song,Huub J. M. Op den Camp,Mike S. M. Jetten,Katharina F. Ettwig
出处
期刊:Applied and Environmental Microbiology [American Society for Microbiology]
卷期号:77 (11): 3877-3880 被引量:155
标识
DOI:10.1128/aem.02960-10
摘要

ABSTRACT Published pmoA primers do not match the pmoA sequence of “ Candidatus Methylomirabilis oxyfera,” a bacterium that performs nitrite-dependent anaerobic methane oxidation. Therefore, new pmoA primers for the detection of “ Ca . Methylomirabilis oxyfera”-like methanotrophs were developed and successfully tested on freshwater samples from different habitats. These primers expand existing molecular tools for the study of methanotrophs in the environment.
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