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Aromatic cluster mutations produce focal modulations of β‐sheet structure

星团(航天器) 测试表 化学 物理 进化生物学 计算生物学 生物 蛋白质结构 生物化学 计算机科学 程序设计语言
作者
Matthew Biancalana,Koki Makabe,Shude Yan,Shohei Koide
出处
期刊:Protein Science [Wiley]
卷期号:24 (5): 841-849 被引量:13
标识
DOI:10.1002/pro.2657
摘要

Site-directed mutagenesis is a powerful tool for altering the structure and function of proteins in a focused manner. Here, we examined how a model β-sheet protein could be tuned by mutation of numerous surface-exposed residues to aromatic amino acids. We designed these aromatic side chain "clusters" at highly solvent-exposed positions in the flat, single-layer β-sheet of Borrelia outer surface protein A (OspA). This unusual β-sheet scaffold allows us to interrogate the effects of these mutations in the context of well-defined structure but in the absence of the strong scaffolding effects of globular protein architecture. We anticipated that the introduction of a cluster of aromatic amino acid residues on the β-sheet surface would result in large conformational changes and/or stabilization and thereby provide new means of controlling the properties of β-sheets. Surprisingly, X-ray crystal structures revealed that the introduction of aromatic clusters produced only subtle conformational changes in the OspA β-sheet. Additionally, despite burying a large degree of hydrophobic surface area, the aromatic cluster mutants were slightly less stable than the wild-type scaffold. These results thereby demonstrate that the introduction of aromatic cluster mutations can serve as a means for subtly modulating β-sheet conformation in protein design.

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