Identification of a short ACE2-derived stapled peptide targeting the SARS-CoV-2 Spike protein

表位 圆二色性 化学 重组DNA 螺旋(腹足类) 蛋白质二级结构 插入(复合材料) 生物化学 立体化学 组合化学 计算生物学 生物 抗体 基因 免疫学 工程类 机械工程 生态学 蜗牛
作者
Lorenzo Calugi,Giulia Sautariello,Elena Lenci,Andrea Trabocchi
标识
DOI:10.26434/chemrxiv-2022-xpqfh
摘要

The design and synthesis of a series of peptide derivatives based on a short ACE2 alpha-helix 1 epitope and subsequent [i - i+4] stapling of the secondary structure resulted in the identification of a 9-mer peptide capable to compete with recombinant ACE2 towards Spike RBD in the micromolar range. Specifically, SARS-CoV-2 Spike inhibitor screening based on colorimetric ELISA assay and structural studies by circular dichroism showed the ring-closing metathesis cyclization being capable to stabilize the helical structure of the 9-mer 34-HEAEDLFYQ-42 epitope better than the triazole stapling via click chemistry. The results are preliminary for the development of small molecule stapled peptides capable of blocking the key ACE2-Spike S1 protein-protein interaction.
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