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Exploring the role of oxidative stress in carotid atherosclerosis: insights from transcriptomic data and single-cell sequencing combined with machine learning

生物 转录组 氧化应激 计算生物学 生物信息学 遗传学 基因 基因表达 生物化学
作者
Yuyou Yang,Mei Dong
出处
期刊:Biology Direct [BioMed Central]
卷期号:20 (1)
标识
DOI:10.1186/s13062-025-00600-7
摘要

Carotid atherosclerotic plaque is the primary cause of cardiovascular and cerebrovascular diseases. It is closely related to oxidative stress and immune inflammation. This bioinformatic study was conducted to identify key oxidative stress-related genes and key immune cell infiltration involved in the formation, progression, and stabilization of plaques and investigate the relationship between them. We show that the up-regulation of oxidative stress-related genes such as IDH1 and CD36 in resident-like macrophages and foam macrophages play a key role in the formation and progression of carotid atherosclerotic plaques. We discuss the role of oxidative stress and immune inflammation in the formation, progression, and stabilization of plaques by combining predictive models with analysis of single-cell data. It introduced novel insights into the mechanisms underlying carotid atherosclerosis formation and plaque progression and may assist in identifying potential therapeutic targets for their treatment.
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