[Relationships between decreased LAMC3 and poor prognosis in ovarian cancer].

免疫组织化学 医学 生物 卵巢癌 内科学 基因 基因表达 肿瘤科 生存分析 图谱 癌症研究 癌症 病理 阶段(地层学) 男科 蛋白质表达 遗传学 免疫学 古生物学
作者
Lei Song,X Liu,Liangping Xia,Yao Ke,Lishuang Wei,L Li,Fuqiang Yin
出处
期刊:PubMed 卷期号:56 (7): 489-497 被引量:3
标识
DOI:10.3760/cma.j.cn112141-20210426-00230
摘要

Objective: To investigate the correlations of laminin subunit gamma 3 (LAMC3) expression with prognosis of ovarian cancer (OC). Methods: LAMC3 protein expression was measured using immunohistochemical streptavidin-peroxidase-biotin connection method (IHC). Gene expression and related clinical data in the cancer genome atlas (TCGA) cohort and clinical proteomic tumor analysis consortium (CPTAC) were applied to analyse the correlation between gene and protein expressions and clinical outcomes. Correlations between LAMC3 and clinicopathological factors were evaluated using the Pearson χ2 test (2-sided). The probability of survival and significance was calculated using the Kaplan-Meier plot. The functional clustering of biological pathways enriched from co-expressed genes of LAMC3 was used to explore the possible mechanisms that LAMC3 might contribute to poor prognosis. Results: Based on the IHC results of 216 OC tissues or ovaries (including 208 tumors and 8 normal tissues) and 51 OC tissues (including 24 chemotherapy-resistant and 27 sensitive tissues), and the protein expression data from CPTAC (including 100 primary tumors and 25 normal tissues), the results showed that the protein expression of LAMC3 was significantly decreased in OC tissues compared with normal, decreased in advanced-stage tissues compared with early-stage tissues, and decreased in drug-resistant tissues compared with sensitive tissues (all P<0.05). Furthermore, low expression of LAMC3 protein was significantly associated with poor disease-free survival (DFS) and overall survival (OS) in 51 OC tissues (P<0.01), consistent with the results that the low levels of LAMC3 mRNA predicted short DFS and OS in 489 OC tissues of the TCGA cohort (P<0.05). The results suggested that low expression of LAMC3 might be the adverse factors for OC development, such as drug resistance and advanced tumors, and might be a risk indicator for prognosis. Moreover, functional clustering of biological pathways enriched from the co-expressed genes of LAMC3 in TCGA ovarian cohort indicated that LAMC3 potentially involved in regulation of OC via oncogene-pathways such as Ras associated protein 1 (Rap1), mitogen-activated protein kinase (MAPK), Ras and cell adhesion-related pathways such as extra cellular matrix (ECM)-receptor interaction and focal adhesion. It indicated that LAMC3 might contribute to short survival and tumor progression by regulation of the above pathways. Conclusion: Low expression of LAMC3 is related to poor prognosis and malignant progression in OC, and thus it is expected to be a new prognostic marker and therapeutic target for clinical treatment.目的: 探讨层粘连蛋白γ3亚基(LAMC3)表达与卵巢上皮性癌(卵巢癌)患者不良预后的相关性。 方法: 应用免疫组化SP法检测卵巢癌组织(包括商品化标本和本研究标本)中LAMC3蛋白的表达,其中商品化标本为购买的卵巢组织微阵列芯片(包括208份卵巢癌组织和8份癌旁正常卵巢组织)、本研究标本为2005年4月至2012年12月在广西医科大学附属肿瘤医院手术治疗的51份Ⅰc~Ⅳ期卵巢癌组织标本(包括24份化疗耐药组织和27份化疗敏感组织);使用癌症基因组图谱(TCGA)队列数据(489份卵巢癌组织)及临床蛋白质组学肿瘤分析协作组(CPTAC)蛋白质组学数据库(包括100份卵巢癌组织和25份癌旁正常卵巢组织)等开放数据对LAMC3表达与卵巢癌患者预后的相关性进行分析;Pearson χ²检验(双侧)分析本研究标本(51份卵巢癌组织)及TCGA队列数据(489份卵巢癌组织)中LAMC3表达与临床病理指标的相关性;Kaplan-Meier法绘制生存曲线,分析LAMC3表达与无疾病生存时间(DFS)和总生存时间(OS)的关系;采用共表达基因的通路富集和功能聚类分析,探讨LAMC3调控卵巢癌患者预后的可能分子机制。 结果: 商品化标本和本研究标本的免疫组化SP法检测结果及CPTAC蛋白质组学数据库中的数据显示,与癌旁正常卵巢组织、早期(Ⅰ~Ⅱ期)卵巢癌组织及卵巢癌化疗敏感组织相比,LAMC3表达在卵巢癌组织、晚期(Ⅲ~Ⅳ期)卵巢癌组织及卵巢癌化疗耐药组织中均显著下调(P<0.05);且在本研究标本(51份卵巢癌组织)中,LAMC3蛋白低表达与卵巢癌患者的不良DFS及OS显著相关(P<0.01),而这一结果在TCGA队列数据(489份卵巢癌组织)中进一步得到验证,发现LAMC3 mRNA低表达也与不良DFS及OS显著相关(P<0.05)。基于TCGA队列数据(489份卵巢癌组织)中LAMC3共表达基因的通路富集和功能聚类分析表明,卵巢癌中LAMC3基因潜在调控Ras相关蛋白1(Rap1)、有丝分裂原活化蛋白激酶(MAPK)、Ras等癌基因信号通路及细胞外基质(ECM)-受体相互作用和黏着斑等细胞黏附相关通路,进而影响卵巢癌的进展和患者的不良预后。 结论: LAMC3低表达与卵巢癌患者的不良预后和肿瘤进展相关,有望作为新的卵巢癌治疗靶点和预后标志物应用于临床。.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
飞快的金鑫应助朴素念波采纳,获得10
1秒前
2秒前
旧城关注了科研通微信公众号
3秒前
3秒前
iwersonshmtu发布了新的文献求助10
3秒前
4秒前
我是萨比发布了新的文献求助10
4秒前
hhhyyyy发布了新的文献求助10
6秒前
7秒前
7秒前
人来人往发布了新的文献求助10
7秒前
烟花应助VVV采纳,获得10
10秒前
华子的五A替身完成签到,获得积分10
11秒前
要努力变强完成签到,获得积分10
11秒前
FANGQUAN发布了新的文献求助10
11秒前
兴奋的香芦完成签到,获得积分10
11秒前
希望天下0贩的0应助旧城采纳,获得10
12秒前
科目三应助一名书生采纳,获得10
14秒前
理想三寻发布了新的文献求助10
14秒前
meng完成签到,获得积分10
14秒前
科研通AI2S应助iwersonshmtu采纳,获得10
15秒前
Luhan完成签到,获得积分10
15秒前
15秒前
hhm完成签到,获得积分10
15秒前
西红柿炒番茄应助慕容松采纳,获得10
15秒前
乐乐应助人来人往采纳,获得10
17秒前
17秒前
daniel完成签到,获得积分10
18秒前
18秒前
19秒前
晶莹雪2943完成签到,获得积分10
20秒前
呆二草完成签到,获得积分10
20秒前
20秒前
22秒前
23秒前
晶莹雪2943发布了新的文献求助10
23秒前
24秒前
情怀应助123采纳,获得10
24秒前
iwersonshmtu完成签到,获得积分10
26秒前
26秒前
高分求助中
Evolution 10000
ISSN 2159-8274 EISSN 2159-8290 1000
Becoming: An Introduction to Jung's Concept of Individuation 600
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 500
The Kinetic Nitration and Basicity of 1,2,4-Triazol-5-ones 440
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3159900
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2810945
关于积分的说明 7889920
捐赠科研通 2469918
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1315243
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 630768
版权声明 602012