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A marine bacterial enzymatic cascade degrades the algal polysaccharide ulvan

单糖 多糖 生物 藻类 生物量(生态学) 生物化学 代谢途径 植物 生态学
作者
Lukas Reisky,Aurélie Préchoux,Marie‐Katherin Zühlke,Marcus Bäumgen,Craig S. Robb,Nadine Gerlach,Thomas Roret,Christian Stanetty,Robert Larocque,Gurvan Michel,Tao Song,Stephanie Markert,Frank Unfried,Marko D. Mihovilovič,Anke Trautwein‐Schult,Dörte Becher,Thomas Schweder,Uwe T. Bornscheuer,Jan‐Hendrik Hehemann
出处
期刊:Nature Chemical Biology [Springer Nature]
卷期号:15 (8): 803-812 被引量:119
标识
DOI:10.1038/s41589-019-0311-9
摘要

Marine seaweeds increasingly grow into extensive algal blooms, which are detrimental to coastal ecosystems, tourism and aquaculture. However, algal biomass is also emerging as a sustainable raw material for the bioeconomy. The potential exploitation of algae is hindered by our limited knowledge of the microbial pathways—and hence the distinct biochemical functions of the enzymes involved—that convert algal polysaccharides into oligo- and monosaccharides. Understanding these processes would be essential, however, for applications such as the fermentation of algal biomass into bioethanol or other value-added compounds. Here, we describe the metabolic pathway that enables the marine flavobacterium Formosa agariphila to degrade ulvan, the main cell wall polysaccharide of bloom-forming Ulva species. The pathway involves 12 biochemically characterized carbohydrate-active enzymes, including two polysaccharide lyases, three sulfatases and seven glycoside hydrolases that sequentially break down ulvan into fermentable monosaccharides. This way, the enzymes turn a previously unexploited renewable into a valuable and ecologically sustainable bioresource. Elucidation of a multi-enzyme pathway for degradation of the polysaccharide ulvan by Formosa agariphila provides tools to use ulvan biomass from marine algal blooms as feedstock for renewable sources of carbohydrates.
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