An outbreak of multiply antibiotic-resistant ST49:ST128:KL11:OCL8 Acinetobacter baumannii isolates at a Sydney hospital

微生物学 爆发 抗生素 医学 脉冲场凝胶电泳 不动杆菌 抗药性 粘菌素 多重耐药 庆大霉素 美罗培南 阿米卡星 亚胺培南 舒巴坦钠 替加环素 抗菌剂 环丙沙星 氨苄西林 多位点序列分型
作者
Mohammad Hamidian,Stephanie J Ambrose,Grace A. Blackwell,Steven J. Nigro,Ruth M. Hall
出处
期刊:Journal of Antimicrobial Chemotherapy [Oxford University Press]
卷期号:76 (4): 893-900 被引量:3
标识
DOI:10.1093/jac/dkaa553
摘要

Objectives To understand the acquisition of resistance genes by a non-GC1, non-GC2 Acinetobacter baumannii strain responsible for a 4 year outbreak at a Sydney hospital. Methods Representative isolates were screened for resistance to antibiotics. Three were subjected to WGS using Illumina HiSeq. One genome was completed with MinION long reads. Resistance regions were compared with known sequences using bioinformatics. Results Isolates were resistant to third-generation cephalosporins, gentamicin and tobramycin, sulfamethoxazole and erythromycin. Sequenced isolates were ST49 (Institut Pasteur scheme) and ST128 (Oxford scheme) and carried KL11 at the capsule locus and OCL8 at the lipooligosaccharide outer core locus. The complete genome of isolate J9 revealed that the resistance genes were all in plasmids; pRAY* contained aadB, and a large plasmid, pJ9-3, contained sul2 and floR genes and a dif module containing the mph(E)-msr(E) macrolide resistance genes. Transposon Tn6168, consisting of a second copy of the chromosomal ampC gene region flanked by ISAba1s, confers resistance to third-generation cephalosporins. Tn6168 is located inside the mph(E)-msr(E) dif module. pJ9-3 includes a set of four dif modules and the orientation of the pdif sites, XerC-XerD or XerD-XerC, alternates. A large transposon, Tn6175, containing tniCABDE transposition genes and genes annotated as being involved in heavy metal metabolism, uptake or export was found in the comM gene. Other ST49:ST128:KL11:OCL8 genomes found in the GenBank WGS database carried Tn6175 but neither of the plasmids carrying the resistance genes. Conclusions An early carbapenem-susceptible A. baumannii outbreak recorded in Australia was caused by an unusual clone that had acquired plasmids carrying antibiotic resistance genes.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
sugr发布了新的文献求助10
刚刚
李123完成签到,获得积分10
刚刚
Robertchen完成签到,获得积分10
刚刚
月月完成签到,获得积分10
1秒前
坚强香旋完成签到,获得积分10
1秒前
spiritpope发布了新的文献求助10
2秒前
三三得九完成签到 ,获得积分10
2秒前
靓丽行天完成签到,获得积分10
4秒前
稳重如萱完成签到,获得积分10
4秒前
小太阳红红火火完成签到,获得积分10
6秒前
7秒前
8秒前
Huang完成签到 ,获得积分0
9秒前
lawson完成签到,获得积分10
9秒前
英姑应助双马尾小男生采纳,获得10
10秒前
浥青竹完成签到,获得积分10
11秒前
舒心的茗完成签到,获得积分10
13秒前
芽芽发布了新的文献求助10
14秒前
sugr完成签到,获得积分20
14秒前
细腻的山水完成签到,获得积分10
14秒前
穆亦擎完成签到 ,获得积分10
14秒前
牛诗悦完成签到,获得积分10
15秒前
雪白的紫翠完成签到 ,获得积分10
15秒前
飞舞的青鱼完成签到,获得积分10
16秒前
落后梦琪发布了新的文献求助10
16秒前
平凡完成签到,获得积分10
16秒前
社恐Forza应助科研通管家采纳,获得10
16秒前
FashionBoy应助科研通管家采纳,获得10
16秒前
赘婿应助科研通管家采纳,获得10
16秒前
ZXG完成签到,获得积分10
17秒前
meteorabob完成签到,获得积分20
17秒前
Herrily完成签到,获得积分10
17秒前
二毛完成签到,获得积分10
18秒前
cugwzr完成签到,获得积分10
18秒前
标致冬日完成签到,获得积分10
20秒前
21秒前
仿真小学生完成签到,获得积分10
21秒前
LJWU应助城123采纳,获得10
23秒前
Archer完成签到,获得积分10
23秒前
shaw完成签到,获得积分10
23秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3183774
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2833906
关于积分的说明 7996028
捐赠科研通 2496133
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1331952
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636466
邀请新用户注册赠送积分活动 603635