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Stargardt disease-associated mutation spectrum of a Russian Federation cohort

ABCA4型 斯塔加德特病 队列 遗传学 桑格测序 视网膜病变 外显子组测序 疾病 医学 人口 生物 突变 内科学 基因 内分泌学 环境卫生 表型 糖尿病
作者
I. V. Zolnikova,В. В. Стрельников,Natalia A. Skvortsova,А. С. Танас,Debmalya Barh,Е В Рогатина,Irina Egorova,D.V. Levina,O. N Demenkova,Egor G. Prikaziuk,Mariya Ivanova
出处
期刊:European Journal of Medical Genetics [Elsevier]
卷期号:60 (2): 140-147 被引量:16
标识
DOI:10.1016/j.ejmg.2016.12.002
摘要

ABCA4-associated mutation screening is extensively performed in European, African, American and several other populations for various retinopathies. However, it has not been well studied in a Russian cohort. Using next-generation (325 genes inherited disease panel) and Sanger sequencing technologies for the first time we documented the spectrum of genetic variations in a Russian retinopathy cohort of 51 patients from 10 ethnic groups. We found ABCA4 variations in 70.5% cases and one case with BEST1 variation. Multiple ABCA4 variations, ABCA4 + RDH12, and ABCA4 + BEST1 variations are also observed and the disease severity is found proportionate to the variation burden. Ten novel ABCA4 variations are detected of which 8 belongs to non-Slavonian population. Most of the detected known variations are found in European and American Stargardt disease populations. No retinopathy causing variation is detected in 14 (27%) cases suggesting that in this Russian retinopathies cohort the causal variants could be in genes that are not covered by our 325 gene panel. Therefore, whole genome/exome analysis is required to identify novel retinopathy associated genes and provide better disease management for this heterogeneous cohort.
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