Structure-based virtual screening of vast chemical space as a starting point for drug discovery

药物发现 虚拟筛选 化学空间 点(几何) 计算生物学 药品 计算机科学 空格(标点符号) 数据科学 生物 生物信息学 药理学 数学 几何学 操作系统
作者
Jens Carlsson,Andreas Luttens
出处
期刊:Current Opinion in Structural Biology [Elsevier]
卷期号:87: 102829-102829
标识
DOI:10.1016/j.sbi.2024.102829
摘要

Structure-based virtual screening aims to find molecules forming favorable interactions with a biological macromolecule using computational models of complexes. The recent surge of commercially available chemical space provides the opportunity to search for ligands of therapeutic targets among billions of compounds. This review offers a compact overview of structure-based virtual screens of vast chemical spaces, highlighting successful applications in early drug discovery for therapeutically important targets such as G protein-coupled receptors and viral enzymes. Emphasis is placed on strategies to explore ultra-large chemical libraries and synergies with emerging machine learning techniques. The current opportunities and future challenges of virtual screening are discussed, indicating that this approach will play an important role in the next-generation drug discovery pipeline.
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