Solvation free energy arithmetic for small organic molecules

溶剂化 隐溶剂化 化学 计算化学 热力学积分 分子 溶剂模型 化学物理 相互作用能 分子动力学 有机化学
作者
Aleksandar Lazaric,Viren Pattni,Kaprao Fuegner,Arieh Y. Ben-Naim,Matthias Heyden
出处
期刊:Journal of Computational Chemistry [Wiley]
卷期号:44 (13): 1263-1277 被引量:3
标识
DOI:10.1002/jcc.27081
摘要

Solvent-mediated interactions contribute to ligand binding affinities in computational drug design and provide a challenge for theoretical predictions. In this study, we analyze the solvation free energy of benzene derivatives in water to guide the development of predictive models for solvation free energies and solvent-mediated interactions. We use a spatially resolved analysis of local solvation free energy contributions and define solvation free energy arithmetic, which enable us to construct additive models to describe the solvation of complex compounds. The substituents analyzed in this study are carboxyl and nitro-groups due to their similar sterical requirements but distinct interactions with water. We find that nonadditive solvation free energy contributions are primarily attributed to electrostatics, which are qualitatively reproduced with computationally efficient continuum models. This suggests a promising route for the development of efficient and accurate models for the solvation of complex molecules with varying substitution patterns using solvation arithmetic.
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