Solvation free energy arithmetic for small organic molecules

溶剂化 隐溶剂化 化学 计算化学 热力学积分 分子 溶剂模型 化学物理 相互作用能 分子动力学 有机化学
作者
Aleksandar Lazaric,Viren Pattni,Kaprao Fuegner,Arieh Ben‐Naim,Matthias Heyden
出处
期刊:Journal of Computational Chemistry [Wiley]
卷期号:44 (13): 1263-1277 被引量:1
标识
DOI:10.1002/jcc.27081
摘要

Abstract Solvent‐mediated interactions contribute to ligand binding affinities in computational drug design and provide a challenge for theoretical predictions. In this study, we analyze the solvation free energy of benzene derivatives in water to guide the development of predictive models for solvation free energies and solvent‐mediated interactions. We use a spatially resolved analysis of local solvation free energy contributions and define solvation free energy arithmetic, which enable us to construct additive models to describe the solvation of complex compounds. The substituents analyzed in this study are carboxyl and nitro‐groups due to their similar sterical requirements but distinct interactions with water. We find that nonadditive solvation free energy contributions are primarily attributed to electrostatics, which are qualitatively reproduced with computationally efficient continuum models. This suggests a promising route for the development of efficient and accurate models for the solvation of complex molecules with varying substitution patterns using solvation arithmetic.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
852应助123采纳,获得10
刚刚
1秒前
nn发布了新的文献求助10
2秒前
圆子完成签到,获得积分10
4秒前
婧婧完成签到,获得积分10
4秒前
tom完成签到,获得积分10
5秒前
6秒前
鸣谦发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
8秒前
8秒前
9秒前
干净砖头发布了新的文献求助10
9秒前
10秒前
超帅的哒完成签到,获得积分20
11秒前
缓慢的可乐完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
共享精神应助明亮的惮采纳,获得10
11秒前
牛马发布了新的文献求助10
11秒前
充电宝应助孤独的根号三采纳,获得10
12秒前
英姑应助zch采纳,获得10
12秒前
做好人难完成签到,获得积分10
13秒前
14秒前
14秒前
sherly完成签到,获得积分10
14秒前
fffff完成签到 ,获得积分10
14秒前
端庄无心发布了新的文献求助10
14秒前
live发布了新的文献求助10
15秒前
Owen应助朴实寻真采纳,获得10
18秒前
NexusExplorer应助lucky燕子采纳,获得10
19秒前
乔树伟完成签到,获得积分10
19秒前
21秒前
yangxiao发布了新的文献求助10
22秒前
如绿豆冰完成签到,获得积分10
22秒前
玩命的语蝶完成签到,获得积分10
24秒前
无限夏之完成签到,获得积分10
25秒前
爆米花应助逸兴遄飞采纳,获得30
25秒前
王文艺发布了新的文献求助10
25秒前
27秒前
28秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Metallurgy at high pressures and high temperatures 2000
Tier 1 Checklists for Seismic Evaluation and Retrofit of Existing Buildings 1000
PowerCascade: A Synthetic Dataset for Cascading Failure Analysis in Power Systems 1000
The Organic Chemistry of Biological Pathways Second Edition 1000
Signals, Systems, and Signal Processing 610
An Introduction to Medicinal Chemistry 第六版习题答案 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 物理 内科学 复合材料 催化作用 物理化学 光电子学 电极 细胞生物学 基因 无机化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6332705
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8149227
关于积分的说明 17105997
捐赠科研通 5388518
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2856548
邀请新用户注册赠送积分活动 1834022
关于科研通互助平台的介绍 1685147