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Spatial transcriptomics analysis of zone-dependent hepatic ischemia-reperfusion injury murine model

转录组 再灌注损伤 肝损伤 缺血 肝移植 雷公藤醇 下调和上调 移植 缺血预处理 医学 生物 药理学 内科学 基因 基因表达 细胞凋亡 生物化学
作者
Jiaqi Xin,Ting Yang,Xiaoyi Wu,Yingting Wu,Yi Liu,Xuan Liu,Mengxi Jiang,Wei Gao
出处
期刊:Communications biology [Springer Nature]
卷期号:6 (1) 被引量:10
标识
DOI:10.1038/s42003-023-04564-0
摘要

Abstract Hepatic ischemia-reperfusion (I/R) injury is a common complication in liver transplantation. The connection between I/R-induced injury response and liver heterogeneity has yet to be fully understood. In this study, we converge histopathological examination with spatial transcriptomics to dissect I/R injury patterns and their associated molecular changes, which reveal that the pericentral zones are most sensitive to I/R injury in terms of histology, transcriptomic changes, and cell type dynamics. Bioinformatic analysis of I/R injury-related pathways predicts that celastrol can protect against liver I/R injury by inducing ischemic pre-conditioning, which is experimentally validated. Mechanistically, celastrol likely implements its protective effect against I/R injury by activating HIF1α signaling and represents a potential strategy for resolving liver I/R.
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