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Development of real‐time recombinase polymerase amplification (RPA) and RPA combined with lateral flow dipstick (LFD) assays for the rapid and sensitive detection of cyprinid herpesvirus 3

重组酶聚合酶扩增 生物 病毒学 量油尺 嗜水气单胞菌 实时聚合酶链反应 病毒 分子生物学 基因 细菌 遗传学 解剖 泌尿系统
作者
Yingying Li,Ruifan Li,Xubing Mo,Yingying Wang,Jiyuan Yin,Sven Bergmann,Yan Ren,Houjun Pan,Cunbin Shi,Defeng Zhang,Qing Wang
出处
期刊:Journal of Fish Diseases [Wiley]
标识
DOI:10.1111/jfd.13960
摘要

Abstract In this issue, we established rapid, cost‐effective, and simple detection methods including recombines polymerase amplification with lateral flow dipstick (RPA‐LFD) and real‐time RPA for cyprinid herpesvirus 3(CyHV‐3), and evaluated their sensitivity, specificity, and applicability, the real‐time RPA method could achieve sensitive diagnosis of CyHV‐3 within 1.3 copies per reaction, respectively. The real‐time RPA method is 10‐fold more sensitive than RPA‐LFD method. The exact number of CyHV‐3 can be calculated in each sample by real‐time RPA. The sera from koi also can be tested in these methods. In addition, no cross‐reaction was observed with other related pathogens, including carp oedema virus (CEV), spring viraemia of carp virus (SVCV), cyprinid herpesvirus 1(CyHV‐1), cyprinid herpesvirus 2(CyHV‐2), type I grass carp reovirus (GCRV‐I), type II GCRV (GCRV‐II), type III GCRV (GCRV‐III), and Aeromonas hydrophila.
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