Monte Carlo molecular simulations with FEASST version 0.25.1

计算机科学 蒙特卡罗方法 直方图 软件 粒度 计算科学 互操作性 理论计算机科学 统计物理学 人工智能 程序设计语言 数学 图像(数学) 物理 统计 操作系统
作者
Harold W. Hatch,Daniel W. Siderius,Vincent K. Shen
出处
期刊:Journal of Chemical Physics [American Institute of Physics]
卷期号:161 (9) 被引量:2
标识
DOI:10.1063/5.0224283
摘要

FEASST is an open-source Monte Carlo software package for particle-based simulations. This software, which was released in 2017, has been used to study phase equilibrium, self-assembly, aggregation or gelation in biological materials, colloids, polymers, ionic liquids, and adsorption in porous networks. We highlight some of the unique features available in FEASST, such as flat-histogram grand canonical ensemble, Gibbs ensemble, and Mayer-sampling simulations with support for anisotropic models and parallelization with flat-histogram and prefetching. We also discuss how the challenges of supporting a variety of Monte Carlo algorithms were overcome by an object-oriented design. This also allows others to extend classes, which improves software interoperability, as inspired by LAMMPS classes and user packages. This article describes version 0.25.1 with benchmarks, compilation instructions, and introductory tutorials for running, restarting, and testing simulations, user guidelines, software design strategies, alternative interfaces, and the test-driven development strategy.

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