High Performance Liquid Chromatography−Mass Spectrometry for Metabonomics: Potential Biomarkers for Acute Deterioration of Liver Function in Chronic Hepatitis B

色谱法 高效液相色谱法 生物标志物 液相色谱-质谱法 质谱法 生物标志物发现 慢性肝炎 化学 串联质谱法 代谢组学 医学 蛋白质组学 生物化学 免疫学 病毒 基因
作者
Jun Yang,Xinjie Zhao,Xiaoli Liu,Chang Wang,Peng Gao,Jiangshan Wang,Lanjuan Li,Jianren Gu,Shengli Yang,Guowang Xu
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:5 (3): 554-561 被引量:148
标识
DOI:10.1021/pr050364w
摘要

Metabonomics methods have been successfully applied to the drug discovery, toxicology, phytochemistry, and clinical fields. Here, we report a self-developed metabonomics platform which is based on high performance liquid chromatography−mass spectrometry (HPLC−MS) technique and applied to the investigation of acute deterioration of liver function in chronic hepatitis B to find the potential biomarkers. Sera from 50 healthy persons and 37 patients with acute deterioration of liver function in chronic hepatitis B were analyzed by HPLC−MS after removal of proteins. After de-noise, peak detection and peak alignment, the data of metabolites were fed to partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) to find the potential biomarkers. According to the corresponding tandem mass results, several potential biomarkers were identified: Lysophosphatidyl Choline (LPC) C18:0, LPC C16:0, LPC C18:1, LPC C18:2, and glycochenodeoxycholic acid (GCDCA) (or its isomer glycodeoxycholic acid (GDCA)). On the basis of the relevant literature and pathway databases, the biological significance of the present study is discussed. Keywords: metabonomics • hepatitis • LC • MS • PLS-DA • serum • biomarker
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