亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

[Immune-related genes and their determined immune cell microenvironment to predict the prognosis of gastric adenocarcinoma].

免疫系统 比例危险模型 肿瘤科 肿瘤微环境 内科学 免疫疗法 生存分析 腺癌 多元分析 生物 癌症研究 医学 癌症 免疫学
作者
N Xia,Lei Xia,W F Zhang,Feng-Hai Zhou
出处
期刊:PubMed 卷期号:102 (12): 840-846 被引量:2
标识
DOI:10.3760/cma.j.cn112137-20211023-02348
摘要

Objective: Through bioinformatics analysis to screen key immune-related genes (IRGs) and cancer-related pathways in gastric adenocarcinoma (GAC) therapy, combining immune cell microenvironment to predict the prognosis of GAC. Methods: RNA sequencing and clinical data were obtained from public databases. Differentially expressed IRGs between GAC and normal tissues were identified by integrated bioinformatics analysis. Univariate and multivariate Cox regression analyses were applied to screen survival-associated IRGs. Then, we established the risk signature model and found another database for external validation. In addition, we explored the relationship with the immune cell microenvironment in each GAC sample using CIBERSORT algorithms. Results: A total of 78 differentially expressed IRGs were screened, including 47 up-regulated and 31 down-regulated genes. Subsequently, a five-IRGs signature (BMP8A、MMP12、NRG4、S100A9 and TUBB3) was significantly associated with the overall survival of GAC patients. Survival analysis indicated that patients in the high-risk group have a poor prognosis. The results of the multivariate analysis revealed that the risk score was an independent prognostic factor. Further analysis showed that the prognostic model had excellent predictive performance in both TCGA and GEO validated cohorts. Besides, the results of tumor-infiltrating immune cell analysis indicated that the risk score could reflect the status of the tumor immune microenvironment. Conclusion: BMP8A, MMP12, NRG4, S100A9 and TUBB3 with the risk signature model are associated with prognosis in patients with GAC, combined with tumor-infiltrating immune cells to provide new markers for immunotherapy in GAC.目的: 通过生物信息学分析筛选胃腺癌的差异表达免疫相关基因及癌症相关通路,结合免疫细胞微环境预测胃腺癌的预后。 方法: 从癌症基因图谱数据库(TCGA)和基因表达(GEO)数据库下载RNA测序数据和临床数据通过生物信息学分析,获得343例胃腺癌组织和30例正常组织中差异表达的免疫相关基因;根据单因素和多因素Cox回归分析筛选与生存相关的免疫相关基因并构建预后风险模型,并使用CIBERSORT算法探索免疫相关基因与免疫细胞微环境的关系。 结果: TCGA数据库中共获得8 202个差异表达基因,其中有4 908个上调差异表达基因、3 294个下调差异表达基因。GSE118916中共获得1 762个差异表达基因,其中909个上调差异表达基因、853个下调差异表达基因。最终获得差异表达免疫相关基因(IRG)共78个,其中47个上调基因、31个下调基因;其中BMP8A、MMP12、NRG4、S100A9和TUBB3证实与胃腺癌患者的生存显著相关。生存分析表明高风险组预后差,多因素分析显示风险评分是独立的预后因素,并在TCGA数据集和GEO外部验证集都有良好预测性能。此外,肿瘤浸润性免疫细胞分析结果表明,该风险评分可以反映肿瘤免疫细胞微环境的状态。 结论: BMP8A、MMP12、NRG4、S100A9和TUBB3及其构建的风险模型与胃腺癌患者的预后相关,结合肿瘤浸润免疫细胞,为胃腺癌的免疫治疗提供新的靶点。.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
山猫大王完成签到 ,获得积分10
12秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
12秒前
zero完成签到,获得积分10
12秒前
14秒前
19秒前
610完成签到 ,获得积分10
24秒前
平常馒头完成签到 ,获得积分10
26秒前
深情安青应助yyy采纳,获得10
28秒前
从容的从寒完成签到,获得积分10
30秒前
32秒前
思源应助从容的从寒采纳,获得10
34秒前
38秒前
无心的婴发布了新的文献求助10
56秒前
1分钟前
Yx发布了新的文献求助10
1分钟前
beetes完成签到,获得积分10
1分钟前
婼汐应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
天天快乐应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
cc应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
充电宝应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
乐乐应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
李大刚完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
Yx完成签到,获得积分10
1分钟前
啤酒白菜发布了新的文献求助10
1分钟前
Glitter完成签到 ,获得积分10
1分钟前
JamesPei应助啤酒白菜采纳,获得10
1分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
2分钟前
科研通AI2S应助xx采纳,获得10
2分钟前
斯寜完成签到,获得积分0
2分钟前
2分钟前
2分钟前
开心寄松发布了新的文献求助10
2分钟前
活泼的狗完成签到,获得积分10
2分钟前
开心寄松完成签到,获得积分10
2分钟前
活泼的狗发布了新的文献求助20
2分钟前
坦率的枕头完成签到,获得积分10
2分钟前
归尘发布了新的文献求助30
3分钟前
高分求助中
The Mother of All Tableaux Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 2400
Ophthalmic Equipment Market by Devices(surgical: vitreorentinal,IOLs,OVDs,contact lens,RGP lens,backflush,diagnostic&monitoring:OCT,actorefractor,keratometer,tonometer,ophthalmoscpe,OVD), End User,Buying Criteria-Global Forecast to2029 2000
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Cognitive Neuroscience: The Biology of the Mind (Sixth Edition) 1000
Optimal Transport: A Comprehensive Introduction to Modeling, Analysis, Simulation, Applications 800
Official Methods of Analysis of AOAC INTERNATIONAL 600
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 588
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3960063
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3506261
关于积分的说明 11128577
捐赠科研通 3238254
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1789645
邀请新用户注册赠送积分活动 871829
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 803056