Metagenomic sequencing-driven multidisciplinary approaches to shed light on the untapped microbial natural products

基因组 计算生物学 生物 DNA测序 天然产物 药物发现 基因组 基因 生物技术 遗传学 生物信息学 生物化学
作者
Changsheng Wu,Yizhen Yin,Le-Le Zhu,Youming Zhang,Yuezhong Li
出处
期刊:Drug Discovery Today [Elsevier]
卷期号:27 (3): 730-742 被引量:4
标识
DOI:10.1016/j.drudis.2021.11.008
摘要

The advantage of metagenomics over the culture-based natural product (NP) discovery pipeline is the ability to access the biosynthetic potential of uncultivable microbes. Advances in DNA sequencing are revolutionizing conventional metagenomics approaches for microbial NP discovery. The genomes of (in)cultivable bugs can be resolved straightforwardly from environmental samples, enabling in situ prediction of biosynthetic gene clusters (BGCs). The predicted chemical diversities could be realized not only by heterologous expression of gene clusters originating from DNA synthesis or direct cloning, but also potentially by bioinformatic-directed organic synthesis or chemoenzymatic total synthesis. In this review, we suggest that metagenomic sequencing in tandem with multidisciplinary approaches will form a versatile platform to shed light on a plethora of microbial 'dark matter'.
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