亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Correlation Analysis of Key Residue Sites between Computational-Aided Design Thermostability d-Amino Acid Oxidase and Ancestral Enzymes

热稳定性 蛋白质设计 蛋白质工程 氨基酸 D 生物催化 生物化学 热稳定性 化学 同系序列 酶动力学 氧化酶试验 蛋白质超家族 立体化学 蛋白质结构 活动站点 催化作用 有机化学 基因 反应机理
作者
Liu‐Yu Wang,Heng Tang,Jin‐Qiao Zhao,Meng‐Nan Wang,Ya‐Ping Xue,Yu‐Guo Zheng
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:71 (50): 20177-20186 被引量:5
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.3c06865
摘要

The d-amino acid oxidase (DAAO) from Rhodotorula taiwanensis has proven to have great potential for applications due to its excellent catalytic kinetic parameters. However, its poor thermal stability has limited its performance in biocatalysis. Herein, starting from the variant SHVG of RtwDAAO, this study employed a comprehensive computational design approach for protein stability engineering, resulting in positive substitutions at specific sites (A43S, T45M, C234L, E195Y). The generated variant combination, SHVG/SMLY, exhibited a significant synergistic effect, leading to an extension of the half-life and Tmapp. The ancestral sequence reconstruction revealed the conservation of the variant sites. The association of the variant sites with the highly stable ancestral enzyme was further explored. After determining the contribution of the variant sites to thermal stability, it was applied to other homologous sequences and validated. Molecular dynamics simulations indicated that the increased hydrophobicity of the variant SHVG/SMLY was a key factor for the increased stability, with strengthened intersubunit interactions playing an important role. In addition, the physical properties of the amino acids themselves were identified as crucial factors for thermal stability generality in homologous enzymes, which is important for the rapid acquisition of a series of stable enzymes.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
小谢完成签到,获得积分10
15秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
20秒前
SciGPT应助科研通管家采纳,获得10
32秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
32秒前
46秒前
1分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
may发布了新的文献求助30
1分钟前
1分钟前
矢思然发布了新的文献求助10
1分钟前
lod完成签到,获得积分10
2分钟前
酷波er应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
zsmj23完成签到 ,获得积分0
2分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
2分钟前
nav完成签到 ,获得积分10
3分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
3分钟前
kmzzy完成签到,获得积分10
4分钟前
Sandy应助AliEmbark采纳,获得30
4分钟前
4分钟前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
4分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
4分钟前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
4分钟前
汉堡包应助科研通管家采纳,获得10
4分钟前
胡可完成签到 ,获得积分10
4分钟前
4分钟前
黄文霜发布了新的文献求助10
5分钟前
5分钟前
科目三应助黄文霜采纳,获得10
5分钟前
Yx发布了新的文献求助10
5分钟前
5分钟前
张琦完成签到 ,获得积分10
5分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
5分钟前
草木完成签到 ,获得积分20
5分钟前
5分钟前
5分钟前
黄文霜发布了新的文献求助10
5分钟前
黄文霜发布了新的文献求助10
6分钟前
高分求助中
The Mother of All Tableaux Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 2400
Ophthalmic Equipment Market by Devices(surgical: vitreorentinal,IOLs,OVDs,contact lens,RGP lens,backflush,diagnostic&monitoring:OCT,actorefractor,keratometer,tonometer,ophthalmoscpe,OVD), End User,Buying Criteria-Global Forecast to2029 2000
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Cognitive Neuroscience: The Biology of the Mind (Sixth Edition) 1000
Optimal Transport: A Comprehensive Introduction to Modeling, Analysis, Simulation, Applications 800
Official Methods of Analysis of AOAC INTERNATIONAL 600
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 588
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3960142
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3506271
关于积分的说明 11128693
捐赠科研通 3238333
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1789703
邀请新用户注册赠送积分活动 871870
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 803069