Theoretical Study of Azetidine Derivative by Quantum Chemical Methods, Molecular Docking and Molecular Dynamic Simulations

分子力学 分子动力学 化学 取代基 对接(动物) 计算化学 量子化学 NS5B 立体化学 分子 有机化学 生物化学 护理部 基因型 基因 医学 肝炎病毒
作者
Prashasti Sinha,Anil Kumar Yadav
出处
期刊:ChemistrySelect [Wiley]
卷期号:8 (16) 被引量:8
标识
DOI:10.1002/slct.202300190
摘要

Abstract Azetidine substituent group has a wide range of application in organic chemistry and medical field. In this study, a novel azetidine derivative and its reaction mechanism has been reported. Using quantum chemical method spectroscopic analysis and other parameters such as electronic and thermodynamic properties were studied to understand the physical as well as chemical behavior of the reported compound. Additionally, to study the antiviral activity, molecular docking studies were carried out against Hepatitis virus C (HCV) NS5B genotype and Norovirus as target protein. In order to validate the docking results molecular dynamic (MD) simulation and Molecular Mechanics‐Poisson‐Boltzmann Surface Area (MM‐PBSA) were calculated at 90 ns. The RMSD was obtained within the range 0.75 Å to 1.5 Å and binding energies (ΔG bind ) for the two complexes was found to be −18.34 kJ/mol and −16.10 kJ/mol for each respective targets.It was found that reported compound can act as potential inhibitor for HCVand Norovirus.
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