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A binary system based DNA tetrahedron and fluorogenic RNA aptamers for highly specific and label-free mRNA imaging in living cells

适体 化学 核糖核酸 DNA 荧光 信使核糖核酸 核酸 四面体 计算生物学 检出限 分子生物学 荧光寿命成像显微镜 生物物理学 纳米技术 生物化学 基因 色谱法 生物 结晶学 物理 材料科学 量子力学
作者
Tong Li,Mengxu Sun,Suping Xia,Ting Huang,Rong-Tian Li,Chunrong Li,Zong Dai,Jin-Xiang Chen,Jun Chen,Nuan Jia
出处
期刊:Talanta [Elsevier]
卷期号:269: 125465-125465 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.talanta.2023.125465
摘要

Developing simple, rapid and specific mRNA imaging strategy plays an important role in the early diagnosis of cancer and the new drugs development. Herein, we have established a novel binary system based DNA tetrahedron and fluorogenic RNA aptamers for highly specific and label-free mRNA imaging in living cells. This developed system consisted of tetrahedron probe A (TPA) and tetrahedron probe B (TPB). TK1 mRNA was chosen as the study model. After TPA and TPB enter into the live cells, the TK1 mRNA induces TPA and TPB to approach and activate the fluorescent aptamer, resulting in enhanced fluorescent signal in the presence of small molecules of DFHBI-1T. By this design, the high specificity label-free detection of nucleic acids was achieved with a detection limit of 1.34 nM. Confocal fluorescence imaging experiments had proved that this strategy could effectively distinguish the TK1 mRNA expression level between normal cell and cancer cell. The developed method is expected to provide a new tool for early diagnosis of diseases and new drug development.
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