Pyrrolizwilline, a unique bacterial alkaloid assembled by a nonribosomal peptide synthetase and non‐enzymatic dimerization

非核糖体肽 生物合成 生物化学 异源表达 生物 立体化学 基因簇 突变体 化学 基因 重组DNA
作者
Juliana Effert,Margaretha Westphalen,Andrea Calderari,­Yi-Ming Shi,Isam Elamri,Soumaya Najah,Peter Grün,Yanyan Li,Arnaud Gruez,Kira J. Weissman,Helge B. Bode
出处
期刊:Angewandte Chemie [Wiley]
标识
DOI:10.1002/anie.202411258
摘要

Pyrrolizidine alkaloids (PAs) are a structurally diverse group of heterocyclic specialized metabolites characterized by a core structure comprising a hexahydro‐1H‐pyrrolizine. PAs are synthesized through two main pathways. In plants, assembly occurs via a homospermidine synthase, and in bacteria, through combined action of a nonribosomal peptide synthetase and a Baeyer‐Villiger monooxygenase. While the toxic properties of plant‐derived PAs and their prevalence in animal and human foods have been extensively studied, the biological roles and biosynthesis of more complex bacterial PAs are not well understood. Here, we report the identification and characterization of a bacterial biosynthetic gene cluster from Xenorhabdus hominickii, xhpA‐G, which is responsible for producing the PA pseudo‐dimer pyrrolizwilline. Analysis of X. hominickii promoter exchange mutants together with heterologous expression of xhpA‐G in E. coli, revealed a set of pathway intermediates, two of which were chemically synthesized, as well as multiple derivatives. This information was leveraged to propose a detailed biosynthetic pathway to pyrrolizwilline. Furthermore, we have characterized the hydrolase XhpG, the key enzyme in the conversion of the pathway intermediate pyrrolizixenamide to pyrrolizwilline, using X‐ray crystallography and small‐angle X‐ray scattering (SAXS).
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