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Exploiting the Innate Plasticity of the Programmed Cell Death‐1 (PD1) Receptor to Design Pembrolizumab H3 Loop Mimics**

彭布罗利珠单抗 表位 单克隆抗体 细胞生物学 生物 计算生物学 化学 抗体 癌症 免疫学 遗传学 免疫疗法
作者
Alexis Richaud,Mehdi Zaghouani,Gang Zhao,Medhi Wangpaichitr,Niramol Savaraj,Stéphane Roche
出处
期刊:ChemBioChem [Wiley]
卷期号:23 (21) 被引量:5
标识
DOI:10.1002/cbic.202200449
摘要

Abstract Checkpoint blockade of the immunoreceptor programmed cell death‐1 (PD1) with its ligand‐1 (PDL1) by monoclonal antibodies such as pembrolizumab provided compelling clinical results in various cancer types, yet the molecular mechanism by which this drug blocks the PD1/PDL1 interface remains unclear. To address this question, we examined the conformational motion of PD1 associated with the binding of pembrolizumab. Our results revealed that the innate plasticity of both C'D and FG loops is crucial to form a deep binding groove (371 Å 3 ) across several distant epitopes of PD1. This analysis ultimately provided a rational‐design to create pembrolizumab H3 loop mimics [RDYRFDMGFD] into β ‐hairpin scaffolds. As a result, a 20‐residue long β ‐hairpin peptide 1 e was identified as a first‐in‐class potent PD1‐inhibitor (EC 50 of 0.29 μM; K i of 41 nM).
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