Paenalcaligenes faecalis sp. nov., a novel species of the family Alcaligenaceae isolated from chicken faeces

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 拉伤 粪便 微生物学 细菌 基因组DNA 核糖体RNA 全基因组测序 基因组 基因 遗传学 动物 解剖
作者
Yiran Zhang,John F. Quensen,Bo Chen,Hailong Li,James Tiedje,Wei Sun,Xun Qian
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (6)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006429
摘要

A Gram-negative, motile, rod-shaped aerobic and alkalogenic bacterium, designated as strain YLCF04 T , was isolated from chicken faeces. Its growth was optimal at 28 °C (range, 10–40 °C), pH 8 (range, pH 6–9) and in 1 % (w/v) NaCl (range, 0–10 %). It was classified to the genus Paenalcaligenes and was most closely related to Paenalcaligenes hominis CCUG 53761A T (97.5 % similarity) based on 16S rRNA gene sequence analysis. Average nucleotide identity and digital DNA–DNA hybridization values between YLCF04 T and P. hominis CCUG 53761A T were 76.3 and 18.2 %, respectively. Strain YLCF04 T has a genome size of 2.7 Mb with DNA G+C content of 46.3 mol%. Based on its phylogenetic, genomic, phenotypic and biochemical characteristics, strain YLCF04 T represents a novel species of the genus Paenalcaligenes , for which the name Paenalcaligenes faecalis sp. nov. is proposed. The type strain is YLCF04 T (=CCTCC AB 2022359 T = KCTC 92789 T ).

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