Molecular Dynamic Investigations of the Mutational Effects on Structural Characteristics and Tunnel Geometry in CYP17A1

CYP17A1型 分子动力学 化学 突变 分子模型 生物物理学 突变体 生物 立体化学 计算化学 生物化学 基因
作者
Yinglu Cui,Qing-Chuan Zheng,Ji-Long Zhang,Qiao Xue,Yan Wang,Hong-Xing Zhang
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
被引量:33
标识
DOI:10.1021/ci400553w
摘要

Cytochrome P450 (CYP) 17A1 is a dual-function monooxygenase with a critical role in the synthesis of many human steroid hormones. The enzyme is an important target for the treatment of breast and prostate cancers that proliferate in response to estrogens and androgens. Despite the ample experimental mutagenesis data, the molecular origin and the structural motifs for the enzymatic activities deficiencies have not been rationalized at the atomic resolution. To this end, we have investigated the effects on structural characteristics and tunnel geometry upon single point mutations in CYP17A1. The MD simulation results combined with PMF calculations and MM-GBSA calculations render an "access mechanism" which encapsulates the effects of mutations on the changes in both structural flexibility and tunnel dynamics, bridging the gap between the theory and the experimentally observed results of enzymatic activity decrease. The underlying molecular mechanism of the heterogeneities in open/closed conformational changes, as well as the wider opening of their respective major tunnels between wt17A1 and two mutants, may be attributed to the closer distances of hydrophobic residues or the disruption of a hydrophobic core. The knowledge of ligand binding characteristics and key residues contributions could guide future experimental and computational work on CYPs so that desirable changes in their enzymatic activities may be achieved. The present study provides important insights into the structure-function relationships of CYP17A1 protein, which could contribute to further understanding about 17-hydroxylase deficiencies and may also improve the understanding of polycystic ovary disease.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
义气依萱发布了新的文献求助10
2秒前
3秒前
4秒前
风再起时完成签到,获得积分20
4秒前
Goal完成签到,获得积分10
4秒前
123发布了新的文献求助10
5秒前
7秒前
小蚂蚁发布了新的文献求助10
8秒前
称心语风发布了新的文献求助10
8秒前
HXB发布了新的文献求助10
8秒前
9秒前
朴实凝阳发布了新的文献求助150
9秒前
13秒前
江J发布了新的文献求助10
13秒前
传统的纸飞机完成签到,获得积分10
14秒前
小田睡不醒完成签到,获得积分20
14秒前
李爱国应助江雨111采纳,获得10
15秒前
17秒前
小鱼完成签到,获得积分10
18秒前
18秒前
小二郎应助屋顶橙子味采纳,获得10
18秒前
昔我依依发布了新的文献求助30
19秒前
爱笑小玉完成签到,获得积分10
19秒前
20秒前
科研通AI2S应助小路采纳,获得10
20秒前
orixero应助Jimmy采纳,获得10
22秒前
lay完成签到,获得积分10
23秒前
在水一方应助务实小鸽子采纳,获得10
23秒前
纯真大门发布了新的文献求助10
24秒前
橘子海发布了新的文献求助10
24秒前
Evan666发布了新的文献求助10
24秒前
星辰大海应助aaaaa采纳,获得10
24秒前
25秒前
小陈发布了新的文献求助10
27秒前
科研通AI2S应助ABS采纳,获得10
27秒前
汉堡包应助南兮采纳,获得10
27秒前
28秒前
zyy完成签到,获得积分10
29秒前
Murray应助橘子海采纳,获得10
30秒前
顺心凡之发布了新的文献求助30
30秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3182271
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2832628
关于积分的说明 7990104
捐赠科研通 2494690
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1330907
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636181
邀请新用户注册赠送积分活动 603114