Molecular Dynamic Investigations of the Mutational Effects on Structural Characteristics and Tunnel Geometry in CYP17A1

CYP17A1型 分子动力学 化学 突变 分子模型 生物物理学 突变体 生物 立体化学 计算化学 生物化学 基因
作者
Yinglu Cui,Qing-Chuan Zheng,Ji-Long Zhang,Qiao Xue,Yan Wang,Hong-Xing Zhang
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
被引量:33
标识
DOI:10.1021/ci400553w
摘要

Cytochrome P450 (CYP) 17A1 is a dual-function monooxygenase with a critical role in the synthesis of many human steroid hormones. The enzyme is an important target for the treatment of breast and prostate cancers that proliferate in response to estrogens and androgens. Despite the ample experimental mutagenesis data, the molecular origin and the structural motifs for the enzymatic activities deficiencies have not been rationalized at the atomic resolution. To this end, we have investigated the effects on structural characteristics and tunnel geometry upon single point mutations in CYP17A1. The MD simulation results combined with PMF calculations and MM-GBSA calculations render an "access mechanism" which encapsulates the effects of mutations on the changes in both structural flexibility and tunnel dynamics, bridging the gap between the theory and the experimentally observed results of enzymatic activity decrease. The underlying molecular mechanism of the heterogeneities in open/closed conformational changes, as well as the wider opening of their respective major tunnels between wt17A1 and two mutants, may be attributed to the closer distances of hydrophobic residues or the disruption of a hydrophobic core. The knowledge of ligand binding characteristics and key residues contributions could guide future experimental and computational work on CYPs so that desirable changes in their enzymatic activities may be achieved. The present study provides important insights into the structure-function relationships of CYP17A1 protein, which could contribute to further understanding about 17-hydroxylase deficiencies and may also improve the understanding of polycystic ovary disease.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
yue完成签到 ,获得积分10
1秒前
上官若男应助西雅采纳,获得30
1秒前
3秒前
陶醉牛排发布了新的文献求助10
4秒前
SSL发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
合适耳机发布了新的文献求助10
5秒前
errui完成签到,获得积分20
6秒前
7秒前
8秒前
我是老大应助Young离子采纳,获得10
9秒前
完美世界应助忆夕采纳,获得10
10秒前
DE2022发布了新的文献求助10
10秒前
草莓熊发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
奥雷里亚诺的小金鱼完成签到,获得积分10
12秒前
田様应助ggbod采纳,获得10
12秒前
合适耳机完成签到,获得积分20
13秒前
西雅发布了新的文献求助30
13秒前
14秒前
陈曦完成签到,获得积分10
14秒前
14秒前
16秒前
哭泣青烟发布了新的文献求助10
16秒前
16秒前
16秒前
Escanor应助武雨寒采纳,获得10
17秒前
林钟完成签到,获得积分10
17秒前
科研通AI2S应助合适耳机采纳,获得10
18秒前
一一发布了新的文献求助10
19秒前
19秒前
草莓熊完成签到,获得积分10
20秒前
武原龙发布了新的文献求助10
20秒前
忆夕发布了新的文献求助10
20秒前
21秒前
21秒前
古山完成签到,获得积分10
21秒前
彭佳乐发布了新的文献求助10
21秒前
坚定可乐完成签到,获得积分10
22秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3182733
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2832981
关于积分的说明 7991795
捐赠科研通 2495103
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1331239
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636256
邀请新用户注册赠送积分活动 603313