Resume Introduction La microbiologie du tractus respiratoire au cours de la mucoviscidose et des dilatations des bronches hors mucoviscidose (DDBHM) est dominee par certains pathogenes comme Pseudomonas aeruginosa. Toutefois, d’autres bacteries comme Achromobacter complexe xylosoxidans, Stenotrophomonas maltophilia et les mycobacteries non tuberculeuses sont actuellement considerees comme emergentes au cours de la mucoviscidose et sont egalement rapportees au cours des DDBHM. Etat des connaissances L’emergence de bacteries pathogenes opportunistes a ete reconnue grâce au suivi national des donnees microbiologiques des patients atteints de mucoviscidose. Malgre l’existence de facteurs d’emergence bacterienne similaires, la creation plus recente des registres de suivi des donnees microbiologiques au cours des DDBHM ne permet pas encore l’identification des bacteries emergentes au cours de ces pathologies. Perspectives Un suivi longitudinal des donnees microbiologiques est necessaire au cours des DDBHM afin de reconnaitre l’emergence de certaines bacteries. Une homogeneisation des pratiques d’analyse microbiologique des expectorations des patients permettrait egalement une comparaison rigoureuse des donnees obtenues pour les patients atteints de mucoviscidose et ceux atteints de DDBHM. Conclusion Diverses bacteries emergentes au cours de la mucoviscidose doivent faire l’objet d’un suivi dans les DDBHM compte tenu de leur role avere dans la degradation de la fonction pulmonaire.