Virtual screening of small-molecule libraries

计算机科学 虚拟筛选 小分子
作者
Qingliang Li
出处
期刊:Elsevier eBooks [Elsevier]
卷期号:: 103-125 被引量:3
标识
DOI:10.1016/b978-0-12-818349-6.00004-2
摘要

Virtual screening is a computational strategy used in drug discovery research to identify active small molecules against a certain biological target from a large chemical library. It typically consists of a cascade of steps to narrow down a set of hits with potential biological activities from a large small-molecule library. Virtual screening methods can be divided into two broad categories: (1) structure-based virtual screening (SBVS) and (2) ligand-based virtual screening (LBVS). SBVS methods utilize target structure information to identify molecules that fit into the binding site of the target structure. It is also named docking-based virtual screening because it uses molecular docking as the core technology. LBVS methods utilize a set of active ligands to identify similar compounds based on certain measurements. In contrast, the LBVS methods directly search a small-molecule library with a set of molecules that known activities. According to the molecular representation, the LBVS methods can be grouped as two–dimensional (2D) fingerprint similarity searching pharmacophore matching and three-dimensional (3D) shape screening. In this work, we introduced the methodology and implementations of both SBVS and LBVS and small-molecular libraries that are widely used in the field, as well as the issues and challenges facing the virtual screening campaigns.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
胡萝卜发布了新的文献求助10
1秒前
所所应助yuhanger采纳,获得10
2秒前
rosalieshi应助踏实的夜白采纳,获得50
3秒前
调研昵称发布了新的文献求助10
4秒前
5秒前
7秒前
整齐凌萱发布了新的文献求助10
10秒前
兔子完成签到 ,获得积分10
11秒前
13秒前
14秒前
lm完成签到,获得积分20
15秒前
16秒前
16秒前
美女完成签到 ,获得积分10
17秒前
17秒前
俭朴的跳跳糖完成签到 ,获得积分10
17秒前
江小白完成签到,获得积分0
18秒前
Neo发布了新的文献求助10
18秒前
yuhanger发布了新的文献求助10
18秒前
xjcy应助Hutch采纳,获得10
20秒前
wangayting发布了新的文献求助30
20秒前
zyy_luck完成签到,获得积分10
20秒前
22秒前
nullsci完成签到,获得积分10
22秒前
lm发布了新的文献求助30
22秒前
大模型应助mrz采纳,获得10
22秒前
dudu完成签到,获得积分20
25秒前
雷生完成签到 ,获得积分10
26秒前
哈哈完成签到,获得积分10
27秒前
28秒前
yuhanger完成签到,获得积分10
30秒前
傻傻的仙人掌完成签到,获得积分10
31秒前
领导范儿应助笑解烦恼结采纳,获得10
31秒前
深情安青应助不爱吃香菜采纳,获得10
31秒前
脑洞疼应助七七采纳,获得10
35秒前
35秒前
科小白完成签到 ,获得积分10
36秒前
deng关注了科研通微信公众号
37秒前
五小关注了科研通微信公众号
38秒前
顾矜应助zyy_luck采纳,获得10
38秒前
高分求助中
Kinetics of the Esterification Between 2-[(4-hydroxybutoxy)carbonyl] Benzoic Acid with 1,4-Butanediol: Tetrabutyl Orthotitanate as Catalyst 1000
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
Rechtsphilosophie 1000
Handbook of Qualitative Cross-Cultural Research Methods 600
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 500
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3139211
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2790129
关于积分的说明 7794004
捐赠科研通 2446563
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1301236
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 626124
版权声明 601109