Ferroptosis related genes participate in the pathogenesis of spinal cord injury via HIF-1 signaling pathway

基因 信号转导 生物 HMOX1型 计算生物学 脊髓损伤 生物信息学 癌症研究 遗传学 神经科学 脊髓 生物化学 血红素 血红素加氧酶
作者
Haoru Dong,Chi Zhang,Donglei Shi,Xiao Xiao,Xingyu Chen,Yuanxiao Zeng,Xiaomu Li,Rong Xie
出处
期刊:Brain Research Bulletin [Elsevier]
卷期号:192: 192-202 被引量:11
标识
DOI:10.1016/j.brainresbull.2022.11.010
摘要

Spinal cord injury (SCI) is a crushing disease without a effective and specific therapeutic strategy. Therefore, it is crucial to uncover underlying mechanism in order to identify potential treatments for SCI. Current studies show ferroptosis might pay important role in SCI.In this study, we aimed to identify the key ferroptosis-related genes providing therapeutic targets for SCI. GSE45006, GSE19890 and GSE156999 from Gene Expression Omnibus (GEO) database were analyzed.A total of 61 ferroptosis-related DEGs were identified, followed by bioinformatics enrichment analyses and PPI network construction. Ten key ferroptosis-related genes were identified by Cytoscape (Cytohubba), most of which were enriched in the HIF-1 signaling pathway. Then we constructed a clip SCI rat model and qPCR was performed to assess the expressions of five genes enriched in HIF-1 signaling pathway (Stat3, Tlr4, Hmox1, Hif1a and Cybb). Finally, a ceRNA network, Stat3, Tlr4, Hmox1/miR127, miR383, miR485/rno-Mut_0003, rno-Pwwp2a_0002 was constructed and expression of mentioned molecules were validated by chip data.Five hub genes from HIF-1 signaling pathway were identified and might play a central role in SCI, which indicated that ferroptosis was correlated with HIF-1 signaling pathway. These results can provide a new insight into molecular mechanisms and identify potential therapeutic targets for SCI.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
小景007完成签到,获得积分10
刚刚
guoguo1119发布了新的文献求助10
1秒前
希勤发布了新的文献求助10
1秒前
苹果鸽子完成签到,获得积分20
1秒前
1秒前
马各骆发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
Andy发布了新的文献求助10
2秒前
简单的银耳汤完成签到,获得积分10
2秒前
猫好好完成签到,获得积分10
3秒前
醉蟹肠粉发布了新的文献求助10
3秒前
3秒前
4秒前
罗又柔完成签到,获得积分10
4秒前
xxwxx应助山山而旧采纳,获得10
4秒前
CipherSage应助ppp采纳,获得30
5秒前
传奇3应助悠旷采纳,获得10
5秒前
石头发布了新的文献求助10
5秒前
辉辉发布了新的文献求助10
6秒前
古卡可可完成签到,获得积分10
7秒前
Liziqi823完成签到,获得积分10
7秒前
甄人达发布了新的文献求助10
7秒前
xTATx完成签到,获得积分10
8秒前
洁净白容应助徐若楠采纳,获得20
8秒前
水沐菁华完成签到,获得积分10
8秒前
火星上曼冬完成签到,获得积分10
8秒前
乐观寻绿完成签到,获得积分10
9秒前
松溪乾完成签到,获得积分10
9秒前
芝麻芝麻开门完成签到,获得积分10
9秒前
李爱国应助xx采纳,获得10
9秒前
10秒前
Nolan完成签到,获得积分10
10秒前
FightingW完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
11秒前
正直的如凡完成签到,获得积分10
13秒前
hyjhhy发布了新的文献求助10
13秒前
NanXin完成签到,获得积分10
14秒前
幽兰拿铁完成签到,获得积分10
14秒前
加肥猫发布了新的文献求助10
14秒前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
Rechtsphilosophie 1000
Bayesian Models of Cognition:Reverse Engineering the Mind 888
Le dégorgement réflexe des Acridiens 800
Defense against predation 800
A Dissection Guide & Atlas to the Rabbit 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3134291
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2785137
关于积分的说明 7770495
捐赠科研通 2440760
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1297506
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 624987
版权声明 600792