Choose Your Own Adventure: A Comprehensive Database of Reactions Catalyzed by Cytochrome P450 BM3 Variants

催化作用 细胞色素P450 化学 数据库 组合化学 计算机科学 有机化学
作者
Douglas J. Fansher,Jonathan N. Besna,Ali Fendri,Joelle N. Pelletier
出处
期刊:ACS Catalysis [American Chemical Society]
卷期号:14 (8): 5560-5592 被引量:13
标识
DOI:10.1021/acscatal.4c00086
摘要

Cytochrome P450 BM3 monooxygenase is the topic of extensive research as many researchers have evolved this enzyme to generate a variety of products. However, the abundance of information on increasingly diversified variants of P450 BM3 that catalyze a broad array of chemistry is not in a format that enables easy extraction and interpretation. We present a database that categorizes variants by their catalyzed reactions and includes details about substrates to provide reaction context. This database of >1500 P450 BM3 variants is downloadable and machine-readable and includes instructions to maximize ease of gathering information. The database allows rapid identification of commonly reported substitutions, aiding researchers who are unfamiliar with the enzyme in identifying starting points for enzyme engineering. For those actively engaged in engineering P450 BM3, the database, along with this review, provides a powerful and user-friendly platform to understand, predict, and identify the attributes of P450 BM3 variants, encouraging the further engineering of this enzyme.
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