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Identification of FUT7 hypomethylation as the blood biomarker in prediction of early-stage lung cancer

生物 肺癌 甲基化 生物标志物 生物标志物发现 阶段(地层学) DNA甲基化 液体活检 腺癌 内科学 癌症 肿瘤科 蛋白质组学 遗传学 基因 医学 古生物学 基因表达
作者
Rong Qiao,Feifei Di,Jun Wang,Yujie Wei,Tian Xu,Liping Dai,Wanjian Gu,Baohui Han,Rongxi Yang
出处
期刊:Journal of Genetics and Genomics [Elsevier]
标识
DOI:10.1016/j.jgg.2023.02.014
摘要

Early detection of lung cancer (LC) is vital for reducing LC-related mortality. However, noninvasive diagnostic tools remain a great challenge. We aim to identify blood-based biomarkers for the early detection of LC. Here, LC-associated hypomethylation in alpha-1,3-fucosyltransferase VII (FUT7) is identified via Illumina 850K array in a discovery study and validated by mass spectrometry in two independent case-control studies with blood samples from 1720 LC patients (86.8% LC at stage I, blood is collected before surgery and treatment) and 3143 healthy controls. Compared to the controls, blood-based FUT7 hypomethylation is identified in LC patients at stage I, and even in LC patients with malignant nodules ≤1 cm and in patients with adenocarcinoma in situ. Gender plays a role in the LC-associated FUT7 hypomethylation in blood, which is more significant in males than in females. We also reveal FUT7 hypomethylation in LC could be enhanced by the advanced stage of cancer, involvement of lymph nodes, and larger tumor size. Based on a large sample size and semi-quantitative methods, our study reveals a strong association between blood-based FUT7 hypomethylation and LC, and suggests methylation signatures in blood might be a group of potential biomarkers for detection of early-stage LC.
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