Efficient and low-complexity variable-to-variable length coding for DNA storage

DNA微阵列 变量(数学) 计算机科学 编码(社会科学) 计算生物学 DNA 生物 遗传学 数学 统计 基因 数学分析 基因表达
作者
Yunfei Gao,Albert No
出处
期刊:BMC Bioinformatics [Springer Nature]
卷期号:25 (1)
标识
DOI:10.1186/s12859-024-05943-y
摘要

Efficient DNA-based storage systems offer substantial capacity and longevity at reduced costs, addressing anticipated data growth. However, encoding data into DNA sequences is limited by two key constraints: 1) a maximum of h consecutive identical bases (homopolymer constraint h), and 2) a GC ratio between
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