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Halostreptopolyspora alba gen. nov., sp. nov., a halophilic actinobacterium isolated from saline soil of Xinjiang, Northwest of China

嗜盐菌 生物 16S核糖体RNA 肽聚糖 二氨基酸 系统发育树 鼠李糖 菌丝体 植物 菌丝 微生物学 细胞壁 细菌 半乳糖 生物化学 基因序列 基因 遗传学
作者
Rui Li,Xiaojing Tang,Yuzhou Feng,Yang Ji,Yun Wang,Cui‐Ping Miao,Mei Tang,Ke-ke wang,Wei‐Xun Chunyu,Lixing Zhao,Shu-Kun Tang
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (10)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006484
摘要

A Gram-stain-positive, aerobic, moderate halophilic actinobacterium, designated strain YIM 96095 T , was isolated from a saline soil sample collected from Aiding Lake, Xinjiang, North-western China. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that the isolate belonged to the family Nocardiopsidaceae , formed a distinct subclade, and was most closely related to Lipingzhangella halophila DSM 102030 T and Allosalinactinospora lopnorensis DSM 45697 T with sequence identity values of 95.8 and 95.1%, respectively. Optimal growth occurred at 37 °C, pH 7.0–8.0 and with 5–16% (w/v) NaCl, with well-developed, non-fragmented substrate mycelia and single-, double-, or triple-wrinkled spore(s) on the mature aerial hyphae. The chemical analysis presented meso -diaminopimelic acid as the diagnostic diamino acid of the cell-wall peptidoglycan, and glucose, galactose and rhamnose as the major whole-cell sugars, and iso-C 15 : 0 and anteiso-C 15 : 0 as the major fatty acids. The phospholipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, unidentified phospholipids and unidentified glycolipid. The menaquinones were MK-10(H 8 ), MK-10(H 6 ) and MK-9(H 10 ). Its G+C content was 69.7 mol% in the determined genome sequence. Based on phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic characteristics, a novel genus and species named Halostreptopolyspora alba gen. nov., sp. nov. is proposed for isolate YIM 96095 T (=KCTC 49266 T =CGMCC 4.7636 T ).
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