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 黄精中与生物碱代谢相关WRKY转录因子家族分析 |
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摘要：为探索黄精和大叶黄精中与生物碱生物合成相关的WRKY转录因子家族基因的差异情况。本研究采用Illumina测序平台对黄精和大叶黄精进行转录组测序，并结合代谢组信息，从生物信息学角度对转录组中鉴定到的WRKY家族成员，进行理化性质、系统进化信息及保守基序等分析。结果显示，在获得的41.38 Gb数据中筛选得到具有显著性差异的WRKY家族转录因子共43个，其中与生物碱相关的1个；理化分析显示氨基酸数目110～956 aa，相对分子质量为13 246.05～107 995.81 kD，等电点5.26～10.23；结合拟南芥的WRKY家族进行系统进化分析，可将WRKY家族成员分成4类。该研究为黄精和大叶黄精的生物碱类化合物研究提供了新的参考数据，也为深入研究WRKY家族的生物学功能提供了科学依据。 关键词： 黄精;大叶黄精;转录组;生物碱;WRKY转录因子; 基金资助： 国家自然科学基金项目(31260057)； 湖北省科技厅技术创新重大专项项目(2019ACA120)共同资助； 专辑： 农业科技 专题： 农作物 分类号： S567.239 |
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