亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Transcriptomic analysis of flower development in tea ( Camellia sinensis (L.))

生物 小桶 WRKY蛋白质结构域 转录组 基因 山茶 MYB公司 从头转录组组装 遗传学 Illumina染料测序 转录因子 基因表达 基因组 计算生物学 植物
作者
Feng Liu,Yu Wang,Zhaotang Ding,Lei Zhao,Jun Xiao,Linjun Wang,Shibo Ding
出处
期刊:Gene [Elsevier]
卷期号:631: 39-51 被引量:31
标识
DOI:10.1016/j.gene.2017.08.013
摘要

Flowering is a critical and complicated process in plant development, involving interactions of numerous endogenous and environmental factors, but little is known about the complex network regulating flower development in tea plants. In this study, de novo transcriptome assembly and gene expression analysis using Illumina sequencing technology were performed. Transcriptomic analysis assembles gene-related information involved in reproductive growth of C. sinensis. Gene Ontology (GO) analysis of the annotated unigenes revealed that the majority of sequenced genes were associated with metabolic and cellular processes, cell and cell parts, catalytic activity and binding. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis indicated that metabolic pathways, biosynthesis of secondary metabolites, and plant hormone signal transduction were enriched among the DEGs. Furthermore, 207 flowering-associated unigenes were identified from our database. Some transcription factors, such as WRKY, ERF, bHLH, MYB and MADS-box were shown to be up-regulated in floral transition, which might play the role of progression of flowering. Furthermore, 14 genes were selected for confirmation of expression levels using quantitative real-time PCR (qRT-PCR). The comprehensive transcriptomic analysis presents fundamental information on the genes and pathways which are involved in flower development in C. sinensis. Our data also provided a useful database for further research of tea and other species of plants.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
2秒前
翔翔超人发布了新的文献求助10
6秒前
9秒前
翔翔超人完成签到,获得积分20
11秒前
代代完成签到 ,获得积分10
12秒前
曾经寒香发布了新的文献求助10
14秒前
搜集达人应助翔翔超人采纳,获得10
17秒前
斯文败类应助科研通管家采纳,获得10
38秒前
39秒前
波波完成签到 ,获得积分10
41秒前
今后应助小文采纳,获得10
49秒前
58秒前
小文发布了新的文献求助10
1分钟前
科目三应助深情断秋采纳,获得10
1分钟前
caroline完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
翔翔超人发布了新的文献求助10
1分钟前
可爱的函函应助翔翔超人采纳,获得10
1分钟前
YUAN121完成签到,获得积分10
2分钟前
昏睡的半鬼完成签到 ,获得积分10
2分钟前
moyu123完成签到,获得积分10
4分钟前
爆米花应助科研通管家采纳,获得10
4分钟前
feijelly完成签到 ,获得积分10
4分钟前
5分钟前
vikonk发布了新的文献求助10
5分钟前
希望天下0贩的0应助vikonk采纳,获得10
5分钟前
爆米花应助好好学习采纳,获得30
6分钟前
6分钟前
研友_VZG7GZ应助人间耙耙柑采纳,获得10
6分钟前
国色不染尘完成签到,获得积分10
6分钟前
6分钟前
好好学习发布了新的文献求助30
6分钟前
6分钟前
深情断秋发布了新的文献求助10
7分钟前
翔翔超人发布了新的文献求助10
7分钟前
7分钟前
陌路完成签到 ,获得积分10
7分钟前
ding应助翔翔超人采纳,获得10
8分钟前
Jasper应助伽利略采纳,获得10
8分钟前
8分钟前
高分求助中
Histotechnology: A Self-Instructional Text 5th Edition 2000
Effect of reactor temperature on FCC yield 1700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 800
Uncertainty Quantification: Theory, Implementation, and Applications, Second Edition 800
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 555
电解铜箔实用技术手册 540
Organic Synthesis 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3284071
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2921638
关于积分的说明 8406824
捐赠科研通 2593294
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1413791
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 658615
邀请新用户注册赠送积分活动 640397