Dense Neural Network for Calculating Solvation Free Energies from Electronegativity-Equalization Atomic Charges

溶剂化 电负性 化学 人工神经网络 隐溶剂化 离子键合 均衡(音频) 离子 水溶液 极地的 物理化学 物理 有机化学 机器学习 数学 量子力学 计算机科学 算法 解码方法
作者
Sergei F. Vyboishchikov
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
卷期号:63 (20): 6283-6292 被引量:1
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.3c00922
摘要

I propose a dense Neural Network for evaluation of solvation free energies ΔG°solv for molecules and ions in water and nonaqueous solvents, Easy Solvation Energy with Electronegativity Equalization charges and Dense Neural Network (ESE-EE-DNN). As input features, it uses the Conductor-like Screening Model (COSMO) electrostatic energy, atomic cavity surface areas, total cavity volume, and induced surface charges. For the COSMO calculation, electronegativity-equalization atomic charges are employed. ESE-EE-DNN exhibits fairly high accuracy, similar or even superior to that of mainstream density functional theory-based methods. For neutral solutes in water, polar protic, polar aprotic, and nonpolar solvents, ESE-EE-DNN yields a root-mean-square error (RMSE) of 1.25, 1.36, 0.70, and 0.71 kcal/mol, respectively. ESE-EE-DNN is particularly advantageous for ionic solutes, with an RMSE of 2.82 and 1.42 kcal/mol for aqueous and nonaqueous ion solutions, correspondingly. ESE-EE-DNN is very efficient due to a fast evaluation of the electronegativity-equalization charges.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
EASA完成签到,获得积分10
刚刚
盛志孟发布了新的文献求助10
刚刚
ss发布了新的文献求助10
刚刚
123完成签到,获得积分10
刚刚
JM完成签到,获得积分10
1秒前
六六发布了新的文献求助10
1秒前
sawyer完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
小熊发布了新的文献求助20
1秒前
1秒前
和谐如容完成签到,获得积分10
2秒前
在写了发布了新的文献求助10
2秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
慕青应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
传奇3应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
斯文败类应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
JamesPei应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
无极微光应助科研通管家采纳,获得20
2秒前
润泉完成签到,获得积分10
2秒前
慕青应助科研通管家采纳,获得30
2秒前
2秒前
爆米花应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
一个圈发布了新的文献求助10
2秒前
华仔应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
天天快乐应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
顾矜应助Aria采纳,获得10
3秒前
3秒前
molihuakai应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
完美世界应助timesever采纳,获得10
3秒前
小二郎应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
小二郎应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
3秒前
bkagyin应助科研通管家采纳,获得30
3秒前
情怀应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
3秒前
3秒前
顾矜应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
3秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Adhesion Science: Principles & Practice 800
The Graphene Handbook (2019 Edition) 700
Signals, Systems, and Signal Processing 610
IEST-RP-CC018: Cleanroom Cleaning and Sanitization: Operating and Monitoring Procedures 600
Fundamentals of Pharmaceutical and Biologics Regulations: A Global Perspective, Second Edition 600
Fundamentals of Modern Mathematics: A Practical Review (Dover Books on Mathematics) 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 物理 内科学 复合材料 催化作用 物理化学 光电子学 电极 细胞生物学 基因 无机化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6532840
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8325950
关于积分的说明 17831577
捐赠科研通 5634166
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2933581
邀请新用户注册赠送积分活动 1909961
关于科研通互助平台的介绍 1768859