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The epigenetic landscape of oligodendrocyte progenitors changes with time

生物 少突胶质细胞 表观遗传学 转录组 组蛋白 染色质 细胞生物学 表观遗传学 遗传学 基因 基因表达 DNA甲基化 髓鞘 神经科学 中枢神经系统
作者
David K. Dansu,Sami Sauma,Dennis Huang,Meng Li,Sarah Moyon,Patrizia Casaccia
标识
DOI:10.1101/2024.02.06.579145
摘要

ABSTRACT SUMMARY Dansu et al. identify distinct histone H4 modifications as potential mechanism underlying the functional differences between adult and neonatal progenitors. While H4K8ac favors the expression of differentiation genes, their expression is halted by H4K20me3. Adult oligodendrocyte progenitors (aOPCs) generate myelinating oligodendrocytes, like neonatal progenitors (nOPCs), but they also display unique functional features. Here, using RNA-sequencing, unbiased histone proteomics analysis and ChIP-sequencing, we define the transcripts and histone marks underlying the unique properties of aOPCs. We describe the lower proliferative capacity and higher levels of expression of oligodendrocyte specific genes in aOPCs compared to nOPCs, as well as the greater levels of H4 histone marks. We also report increased occupancy of the H4K8ac mark at chromatin locations corresponding to oligodendrocyte-specific transcription factors and lipid metabolism genes. Pharmacological inhibition of H4K8ac deposition reduces the levels of these transcripts in aOPCs, rendering their transcriptome more similar to nOPCs. The repressive H4K20me3 mark is also higher in aOPCs compared to nOPCs and pharmacological inhibition of its deposition results in increased levels of genes related to the mature oligodendrocyte state. Overall, this study identifies two histone marks which are important for the unique transcriptional and functional identity of aOPCs.
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