Immune Infiltration Profiling in Nonsmall Cell Lung Cancer and Their Clinical Significance: Study Based on Gene Expression Measurements

免疫系统 生物 危险系数 生存分析 比例危险模型 肿瘤科 肺癌 内科学 基因表达谱 免疫学 癌症研究 置信区间 基因 基因表达 医学 遗传学
作者
Fangyao Chen,Yuhui Yang,Yaling Zhao,Leilei Pei,Hong Yan
出处
期刊:DNA and Cell Biology [Mary Ann Liebert]
卷期号:38 (11): 1387-1401 被引量:17
标识
DOI:10.1089/dna.2019.4899
摘要

Immune cell infiltration is associated with the prognosis of cancer. This study focused on the immune infiltration profiling and their association with survival outcome in nonsmall cell lung cancer (NSCLC). Research data were obtained from the Gene Expression Omnibus and The Cancer Genome Atlas databases. CIBERSORT algorithm was applied to assess the relative proportions of 22 kinds of immune cells. Log-rank test was performed to compare the survival outcome of patients with different proportions of immune cells. The estimated hazard ratios were presented with forest plot. Multivariate Cox regression analysis was conducted to estimate the adjusted associations between different types of infiltrating immune cells and survival prognosis controlling for other clinical features and confounders. With the CIBERSORT approach, we assessed the proportions of 22 infiltrating immune cells of 2050 cases with NSCLC. By conducting survival analysis, we found different survival outcomes among cases with different proportions of certain types of infiltrating immune cells. Among the cell subsets investigated, plasma cells (hazard ratio [HR] = 0.775, 95% confidence interval [CI]: 0.669-0.898) and regulatory T cells (HR = 1.258, 95% CI: 1.091-1.451) were associated with survival outcome of NSCLC patients controlling for other covariates. Subgroup analysis suggested a good consistency and robustness of our results. Our findings might provide useful information for prognosis prediction and cellular study in NSCLC.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Planetary发布了新的文献求助10
1秒前
啤酒白菜发布了新的文献求助10
1秒前
Crazy111发布了新的文献求助10
2秒前
红豆面包发布了新的文献求助10
3秒前
JamesPei应助感性的梦竹采纳,获得10
3秒前
5秒前
6秒前
Planetary完成签到,获得积分10
8秒前
上官若男应助mjn404采纳,获得10
9秒前
10秒前
10秒前
东北三省发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
Owen应助月亮煮粥采纳,获得10
13秒前
小田发布了新的文献求助10
13秒前
16秒前
vivianzhang完成签到,获得积分10
16秒前
是大法官寒假快乐完成签到,获得积分10
16秒前
阿花阿花完成签到,获得积分10
18秒前
19秒前
19秒前
东北三省完成签到,获得积分10
19秒前
orange9发布了新的文献求助10
20秒前
21秒前
韩倩完成签到 ,获得积分10
21秒前
mjn404发布了新的文献求助10
23秒前
Joanna发布了新的文献求助10
24秒前
25秒前
28秒前
橙子发布了新的文献求助10
31秒前
vivi完成签到,获得积分10
32秒前
32秒前
LiLi发布了新的文献求助10
33秒前
竹桃完成签到 ,获得积分10
33秒前
stk完成签到,获得积分10
34秒前
乐乐应助25采纳,获得10
34秒前
万幸鹿完成签到,获得积分10
35秒前
喜悦芝麻完成签到 ,获得积分10
35秒前
starofjlu应助NTHU_KAO采纳,获得30
35秒前
拾云完成签到,获得积分10
40秒前
高分求助中
Evolution 10000
Sustainability in Tides Chemistry 2800
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
An Introduction to Geographical and Urban Economics: A Spiky World Book by Charles van Marrewijk, Harry Garretsen, and Steven Brakman 600
Diagnostic immunohistochemistry : theranostic and genomic applications 6th Edition 500
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3151919
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2803228
关于积分的说明 7852576
捐赠科研通 2460608
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1309955
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 629070
版权声明 601760