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Parallel evolution, atavism, and extensive introgression explain the radiation of Epimedium sect. Diphyllon (Berberidaceae) in southern East Asia

渗入 谱系(遗传) 起源 进化生物学 生物 适应性辐射 植物进化 东亚 生物多样性热点 生态学 生物地理学 生物多样性 地理 系统发育学 中国 计算机网络 生物化学 考古 基因组 基因 计算机科学
作者
Cheng Zhang,Ran Meng,Ying Meng,Baolin Guo,Quan‐Ru Liu,Ze‐Long Nie
出处
期刊:Frontiers in Plant Science [Frontiers Media SA]
卷期号:14 被引量:1
标识
DOI:10.3389/fpls.2023.1234148
摘要

East Asia is the richest region of plant biodiversity in the northern temperate zone, and its radiation provides key insights for understanding rapid speciation, including evolutionary patterns and processes. However, it is challenging to investigate the recent evolutionary radiation among plants because of the lack of genetic divergence, phenotypic convergence, and interspecific gene flow. Epimedium sect. Diphyllon is a rarely studied plant lineage endemic to East Asia, especially highly diversified in its southern part. In this study, we report a robust phylogenomic analysis based on genotyping-by-sequencing data of this lineage. The results revealed a clear biogeographic pattern for Epimedium sect. Diphyllon with recognition into two major clades corresponding to the Sino-Himalayan and Sino-Japanese subkingdoms of East Asian Flora and rapid diversification of the extant species dated to the Pleistocene. Evolutionary radiation of Epimedium sect. Diphyllon is characterized by recent and predominant parallel evolution and atavism between the two subkingdom regions, with extensive reticulating hybridization within each region during the course of diversification in southern East Asia. A parallel-atavism-introgression hypothesis is referred to in explaining the radiation of plant diversity in southern East Asia, which represents a potential model for the rapid diversification of plants under global climate cooling in the late Tertiary. Our study advances our understanding of the evolutionary processes of plant radiation in East Asia as well as in other biodiversity hotspot regions.
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