[Coronary artery segmentation based on Transformer and convolutional neural networks dual parallel branch encoder neural network].

卷积神经网络 编码器 计算机科学 变压器 分割 人工智能 人工神经网络 模式识别(心理学) 心脏病学 医学 电气工程 工程类 电压 操作系统
作者
Dan Pan,Genqiang Luo,An Zeng
出处
期刊:PubMed 卷期号:41 (6): 1195-1203
标识
DOI:10.7507/1001-5515.202403058
摘要

Manual segmentation of coronary arteries in computed tomography angiography (CTA) images is inefficient, and existing deep learning segmentation models often exhibit low accuracy on coronary artery images. Inspired by the Transformer architecture, this paper proposes a novel segmentation model, the double parallel encoder u-net with transformers (DUNETR). This network employed a dual-encoder design integrating Transformers and convolutional neural networks (CNNs). The Transformer encoder transformed three-dimensional (3D) coronary artery data into a one-dimensional (1D) sequential problem, effectively capturing global multi-scale feature information. Meanwhile, the CNN encoder extracted local features of the 3D coronary arteries. The complementary features extracted by the two encoders were fused through the noise reduction feature fusion (NRFF) module and passed to the decoder. Experimental results on a public dataset demonstrated that the proposed DUNETR model achieved a Dice similarity coefficient of 81.19% and a recall rate of 80.18%, representing improvements of 0.49% and 0.46%, respectively, over the next best model in comparative experiments. These results surpassed those of other conventional deep learning methods. The integration of Transformers and CNNs as dual encoders enables the extraction of rich feature information, significantly enhancing the effectiveness of 3D coronary artery segmentation. Additionally, this model provides a novel approach for segmenting other vascular structures.

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