Landscape and the immune patterns of cuproptosis in oral squamous cell carcinoma

基因 癌症 生物 免疫系统 细胞 基底细胞 癌症研究 癌变 肿瘤科 医学 病理 免疫学 遗传学
作者
Yuan Dong,Xinqiang Li,Fang‐wen Qu,Yue Wang
出处
期刊:Journal of Oral Pathology & Medicine [Wiley]
卷期号:52 (10): 951-960 被引量:3
标识
DOI:10.1111/jop.13489
摘要

Abstract Background Oral squamous cell carcinoma is an increasingly prevalent cancer type characterized by high incidence and mortality rates. Its early detection is challenging, primarily because of the absence of early molecular markers. Cuproptosis is a novel regulatory mechanism of cell death with implications in various cancers. In this study, we aimed to study cuproptosis‐related genes in oral squamous cell carcinoma to identify their prognostic value. Methods By analyzing genomic, bulk RNA‐seq, and single‐cell RNA‐seq data, we investigated 13 cuproptosis‐related genes in The Cancer Genome Atlas‐Oral Squamous Cell Carcinoma dataset and Gene Expression Omnibus repository (GSE172577). Results ATP7A , ATP7B , and DLST were the most frequently mutated genes, with nine of our studied genes associated with overall survival. Single‐cell analysis was conducted to identify cuproptosis‐related tumor cells in oral squamous cell carcinoma, which revealed two distinct patterns based on the expression of cuproptosis‐related genes. These patterns exhibit differences in genetic alterations and tumor immune microenvironment. Finally, we developed a cuproptosis index using a random forest algorithm based on cuproptosis pattern‐related genes in which higher levels were linked to poorer prognosis. Conclusion Our findings provide valuable insights into the mechanisms underlying oral squamous cell carcinoma‐associated cuproptosis.
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