Key Interaction Changes Determine the Activation Process of Human Parathyroid Hormone Type 1 Receptor

化学 甲状旁腺激素 受体 鸟苷 生物物理学 G蛋白偶联受体 计算生物学 环磷酸鸟苷 分子动力学 生物化学 计算化学 生物 有机化学 一氧化氮
作者
Yue Zhang,Qing‐Chuan Zheng,Arieh Warshel,Chen Bai
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/jacs.4c15025
摘要

The parathyroid hormone type 1 receptor (PTH1R) plays a crucial role in modulating various physiological functions and is considered an effective therapeutic target for osteoporosis. However, a lack of detailed molecular and energetic information about PTH1R limits our comprehensive understanding of its activation process. In this study, we performed computational simulations to explore key events in the activation process, such as conformational changes in PTH1R, Gs protein coupling, and the release of guanosine diphosphate (GDP). Our analysis identified kinetic information, including the rate-determining step, transition state, and energy barriers. Free-energy and structural analyses revealed that GDP could be released from the Gs protein when the binding cavity is partially open. Additionally, we predicted important residues, including potential pathogenic mutations, and verified their significance through site-directed mutations. These findings enhance our understanding of class B GPCR activation mechanisms. Furthermore, the methodology employed in this study can be applied to other biophysical systems.
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