[Molecular characteristics of serogroup B neisseria meningitidis, China].

脑膜炎奈瑟菌 多位点序列分型 生物 奈瑟菌 微生物学 打字 谱系(遗传) 基因 病毒学 序列分析 基因型 遗传学 细菌
作者
Bingqing Zhu,Wenwan Gao,Li‐Wen Xu,Yanling Gao,Zhongjun Shao
出处
期刊:PubMed 卷期号:53 (2): 153-158 被引量:1
标识
DOI:10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2019.02.006
摘要

Objective: To investigate the molecular characteristics of serogroup B neisseria meningitidis in China. Methods: Total of 485 (100 strains isolated from cerebrospinal fluid or blood samples of encephalomyelitis cases, and 385 strains isolated from nasopharynx of healthy carriers) Meningococcal serogroup B (MenB) strains, isolated from 29 provinces of China between 1968 and 2016, were analyzed by multilocus sequence typing (MLST) and PorA typing methods. Further, the genetic diversity of three MenB vaccine proteins, FHbp, NadA and NHBA, were analyzed. Results: The 485 study strains belonged to 270 sequence types (STs), 107 of which (representing 211 strains) could be grouped into ten clonal complexes (CC). CC4821 has been the predominant lineage in China since 2005 (28.7%, n=139). The most common PorA types of MenB strains from invasive meningococcal cases were P1.5-2,2-2 (10.0%, n=10), P1.5-1,2-2 (9.0%, n=9) and P1.5-1,10-4 (9.0%, n=9). Four hundred and twenty one strains had intact fhbp gene; variant 1, 2 and 3 accounted for 12.8% (54 strains), 85.0% (358 strains) and 2.2% (9 strains) respevtively. Ten out of 432 strains (2.3%) contained complete nadA gene. All the 172 strains for which the nhba gene was sequenced had intact gene sequence which corresponded to 68 peptide types. Conclusion: CC4821 was the predominant CC of MenB strains in China; the vaccine proteins were diverse about the sequences. The vaccine proteins should be carefully selected when developing MenB vaccines in China.目的: 分析中国B群脑膜炎奈瑟菌分子流行病学特征。 方法: 485株B群脑膜炎奈瑟菌为1968—2016年分离和收集于29个省份的菌株,包括流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例脑脊液或血液标本分离菌株100株,健康带菌者鼻咽部分离菌株385株。根据多位点序列分型(MLST)网站公布的方法,对菌株进行PorA外膜蛋白分型和MLST分型,采用Bionumerics软件分析序列型(ST型),构建最小生成树;针对B群脑膜炎奈瑟菌蛋白疫苗的主要成分FHbp、NadA和NHBA蛋白进行分子型别分布和序列特征分析。 结果: 485株B群脑膜炎奈瑟菌分为270种ST型,其中107种ST型(211株菌)可归入已知的10个克隆群,163种ST型(274株)不能归入任何克隆群;CC4821为主要流行的克隆群(28.7%,139株)。病例分离菌株的主要PorA型为P1.5-2,2-2(10.0%,10株)、P1.5-1,2-2(9.0%,9株)和P1.5-1,10-4(9.0%,株)。421株含有完整的FHbp氨基酸序列,其中变异1型(v1)、2型(v2)和3型(v3)(菌株分别占12.8%(54株)、85.0%(358株)和2.2%(9株)。432株完成)nadA(基)因测序,其中10株((2.3%)含有完整的)nadA(基)因。172株完成nhba基因测序,均具有完整的nhba基因序列,其中170株的NHBA氨基酸序列共分为68个型,呈现出多态性特征。 结论: 中国B群脑膜炎奈瑟菌优势克隆群为CC4821;其疫苗相关蛋白多态性较强。中国应该根据本国菌株的特征慎重选择B群流脑疫苗候选蛋白。.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
张无缺完成签到,获得积分10
2秒前
4秒前
CodeCraft应助MES采纳,获得10
5秒前
笨笨乘风完成签到,获得积分10
6秒前
田様应助axunQAQ采纳,获得10
8秒前
完美秋烟发布了新的文献求助10
8秒前
无花果应助糊涂的小伙采纳,获得10
8秒前
白betty完成签到,获得积分10
8秒前
MQ&FF完成签到,获得积分0
9秒前
啦啦啦完成签到,获得积分10
10秒前
11秒前
12秒前
英俊的铭应助小安采纳,获得10
13秒前
14秒前
sun完成签到,获得积分10
14秒前
耍酷的夏云应助勤劳落雁采纳,获得10
16秒前
16秒前
ywang发布了新的文献求助10
16秒前
车秋寒完成签到,获得积分10
16秒前
刘哈哈关注了科研通微信公众号
16秒前
葱饼完成签到 ,获得积分10
17秒前
Anquan完成签到,获得积分10
17秒前
yudandan@CJLU发布了新的文献求助10
18秒前
鱼儿123完成签到,获得积分10
18秒前
端庄的访枫完成签到 ,获得积分10
19秒前
车秋寒发布了新的文献求助10
19秒前
19秒前
完美秋烟完成签到,获得积分10
20秒前
21秒前
23秒前
lee1992完成签到,获得积分10
23秒前
nextconnie发布了新的文献求助10
24秒前
nextconnie发布了新的文献求助10
24秒前
nextconnie发布了新的文献求助10
24秒前
CO2发布了新的文献求助10
25秒前
uniquedl完成签到 ,获得积分10
25秒前
nextconnie发布了新的文献求助10
25秒前
子伊完成签到 ,获得积分10
26秒前
29秒前
29秒前
高分求助中
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 3000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Ensartinib (Ensacove) for Non-Small Cell Lung Cancer 1000
Unseen Mendieta: The Unpublished Works of Ana Mendieta 1000
Bacterial collagenases and their clinical applications 800
El viaje de una vida: Memorias de María Lecea 800
Luis Lacasa - Sobre esto y aquello 700
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 物理化学 催化作用 量子力学 光电子学 冶金
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3527998
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3108225
关于积分的说明 9288086
捐赠科研通 2805889
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1540195
邀请新用户注册赠送积分活动 716950
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 709849