Skin in the game: a review of single-cell and spatial transcriptomics in dermatological research

简编 特应性皮炎 银屑病 转录组 计算生物学 医学 生物信息学 生物 皮肤病科 基因表达 基因 遗传学 地理 考古
作者
Samuel Schepps,Jonathan Xu,Henry Yang,Jenna Mandel,Jaanvi Mehta,Julianna Tolotta,Nicole M. Baker,Volkan Tekmen,Neda Nikbakht,Paolo Fortina,Ignacia Fuentes,Bonnie LaFleur,Raymond J. Cho,Andrew P. South
出处
期刊:Clinical Chemistry and Laboratory Medicine [De Gruyter]
卷期号:62 (10): 1880-1891 被引量:2
标识
DOI:10.1515/cclm-2023-1245
摘要

Abstract Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) are two emerging research technologies that uniquely characterize gene expression microenvironments on a cellular or subcellular level. The skin, a clinically accessible tissue composed of diverse, essential cell populations, serves as an ideal target for these high-resolution investigative approaches. Using these tools, researchers are assembling a compendium of data and discoveries in healthy skin as well as a range of dermatologic pathophysiologies, including atopic dermatitis, psoriasis, and cutaneous malignancies. The ongoing advancement of single-cell approaches, coupled with anticipated decreases in cost with increased adoption, will reshape dermatologic research, profoundly influencing disease characterization, prognosis, and ultimately clinical practice.
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