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MGCEP 1.0: A Genetic-Engineered Marine-Derived Chassis Cell for a Scaled Heterologous Expression Platform of Microbial Bioactive Metabolites

异源表达 异源的 生物 基因 转录组 基因簇 次生代谢物 计算生物学 合成生物学 非核糖体肽 底盘 链霉菌 基因表达 生物化学 细菌 遗传学 生物合成 重组DNA 工程类 结构工程
作者
Zhijie Yang,Chunyu Liu,Yuyang Wang,Yingying Chen,Qinglian Li,Yun Zhang,Qi Chen,Jianhua Ju,Junying Ma
出处
期刊:ACS Synthetic Biology [American Chemical Society]
卷期号:11 (11): 3772-3784 被引量:14
标识
DOI:10.1021/acssynbio.2c00362
摘要

Marine microorganisms produce a variety of bioactive secondary metabolites, which represent a significant source of novel antibiotics. Heterologous expression is a valuable tool for discovering marine microbial secondary metabolites; however, marine-derived chassis cell is very scarce. Here, we build an efficient plug-and-play marine-derived gene clusters expression platform 1.0 (MGCEP 1.0) by the systematic engineering of the deep-sea-derived Streptomyces atratus SCSIO ZH16. For a proof of concept, four families of microbial bioactive metabolite biosynthetic gene clusters (BGCs), including alkaloids, aminonucleosides, nonribosomal peptides, and polyketides, were efficiently expressed in this platform. Moreover, 19 compounds, including two new angucycline antibiotics, were produced in MGCEP 1.0. Dynamic patterns of global biosynthetic gene expression in MGCEP 1.0 with or without a heterologous gene cluster were revealed at the transcriptome level. The platform MGCEP 1.0 provides new possibilities for expressing microbial secondary metabolites, especially of marine origin.
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