Transcriptome Sequencing of the Pale Anemones (Exaiptasia diaphana) Revealed Functional Peptide Gene Resources of Sea Anemone

海葵 银莲花 生物 毒液 功能多样性 计算生物学 生态学 生物化学
作者
Jinxing Fu,Yanbin He,Chao Peng,Tianle Tang,Aihua Jin,Yanling Liao,Qiong Shi,Bingmiao Gao
出处
期刊:Frontiers in Marine Science [Frontiers Media SA]
卷期号:9 被引量:10
标识
DOI:10.3389/fmars.2022.856501
摘要

Sea anemone venom is a marine drug resource library with pharmacological and biotechnology value, and it contains complex and diverse functional peptide neurotoxins. However, the venom components of only a limited number of sea anemone species have been globally evaluated by transcriptomics and proteomics. In this study, 533 putative protein as well as peptide toxin sequences were found on a large scale from dissimilar developmental stages of sea anemone Exaiptasia diaphana , which can be divided into 75 known superfamilies according to the predicted functions. Among them, the proportion of protein is 72.98%, and its main families are metalloproteases, chymotrypsinogen like, collagen, pancreatic lipase-associated protein like, and G-protein coupled receptor, while the proportion of peptides is 27.02%, and main families are ShK domain, thrombin, Kunitz-type, defensin, as well as insulin-like peptide. Finally, typical anemone peptide neurotoxins were screened, and the 3D structure and pharmacological activity of these anemone peptide neurotoxins were predicted by homology modeling. We elucidate on a valuable high-throughput approach for obtaining sea anemone proteins and peptides. Our findings form the basis for targeted studies on the diversity as well as pharmacological effects of sea anemone peptide neurotoxins.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
张占完成签到,获得积分10
刚刚
席谷兰完成签到 ,获得积分10
6秒前
Kong完成签到,获得积分10
6秒前
朱诗源完成签到 ,获得积分10
8秒前
新手发布了新的文献求助10
10秒前
Tina酱完成签到,获得积分10
10秒前
AU完成签到 ,获得积分10
11秒前
加肥猫完成签到,获得积分10
12秒前
甜美的夏之完成签到,获得积分10
15秒前
陆晓亦完成签到,获得积分10
16秒前
liu完成签到 ,获得积分10
20秒前
时势造英雄完成签到 ,获得积分10
20秒前
二不二完成签到,获得积分10
21秒前
kakaC完成签到 ,获得积分10
24秒前
清新的剑心完成签到 ,获得积分10
24秒前
尚影芷完成签到,获得积分10
25秒前
澄明的晨星完成签到,获得积分10
26秒前
黄迪迪完成签到 ,获得积分10
26秒前
淡淡完成签到 ,获得积分10
30秒前
蕉鲁诺蕉巴纳完成签到,获得积分10
30秒前
一拳一个小欧阳完成签到 ,获得积分10
31秒前
刘哈哈完成签到 ,获得积分10
32秒前
唯梦完成签到 ,获得积分10
36秒前
36秒前
社恐科研狗完成签到,获得积分10
42秒前
Nicole完成签到 ,获得积分10
42秒前
香蕉寒梅发布了新的文献求助10
42秒前
46秒前
wnll完成签到,获得积分10
47秒前
孤独黑猫完成签到 ,获得积分10
50秒前
wnll发布了新的文献求助10
50秒前
Hmxu完成签到,获得积分10
51秒前
March完成签到,获得积分10
52秒前
香蕉寒梅完成签到,获得积分10
52秒前
负责的寒梅完成签到 ,获得积分10
53秒前
体贴的小翠完成签到,获得积分10
53秒前
poplar完成签到,获得积分10
53秒前
caicai完成签到,获得积分10
54秒前
dlut0407完成签到,获得积分10
55秒前
乐观的饭饭完成签到 ,获得积分10
56秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
2-Acetyl-1-pyrroline: an important aroma component of cooked rice 500
Ribozymes and aptamers in the RNA world, and in synthetic biology 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3180028
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2830388
关于积分的说明 7976586
捐赠科研通 2491954
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1329130
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 635669
版权声明 602954