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The Role of Aryl Hydrocarbon Receptor in Bone Biology

芳香烃受体 骨吸收 生物 转录因子 信号转导 细胞生物学 骨重建 转录组 内分泌学 生物化学 基因表达 基因
作者
Sagar Vyavahare,Pankaj Ahluwalia,Sonu Gupta,Ravindra Kolhe,William Hill,Mark W. Hamrick,Carlos M. Isales,Sadanand Fulzele
出处
期刊:International journal of tryptophan research [SAGE]
卷期号:17
标识
DOI:10.1177/11786469241246674
摘要

Aryl hydrocarbon receptor (AhR), a ligand-activated transcription factor, is crucial in maintaining the skeletal system. Our study focuses on encapsulating the role of AhR in bone biology and identifying novel signaling pathways in musculoskeletal pathologies using the GEO dataset. The GEO2R analysis identified 8 genes (CYP1C1, SULT6B1, CYB5A, EDN1, CXCR4B, CTGFA, TIPARP, and CXXC5A) involved in the AhR pathway, which play a pivotal role in bone remodeling. The AhR knockout in hematopoietic stem cells showed alteration in several novel bone-related transcriptomes (eg, Defb14, ZNF 51, and Chrm5). Gene Ontology Enrichment Analysis demonstrated 54 different biological processes associated with bone homeostasis. Mainly, these processes include bone morphogenesis, bone development, bone trabeculae formation, bone resorption, bone maturation, bone mineralization, and bone marrow development. Employing Functional Annotation and Clustering through DAVID, we further uncovered the involvement of the xenobiotic metabolic process, p450 pathway, oxidation-reduction, and nitric oxide biosynthesis process in the AhR signaling pathway. The conflicting evidence of current research of AhR signaling on bone (positive and negative effects) homeostasis may be due to variations in ligand binding affinity, binding sites, half-life, chemical structure, and other unknown factors. In summary, our study provides a comprehensive understanding of the underlying mechanisms of the AhR pathway in bone biology.

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