Proteome profiling of cerebrospinal fluid reveals biomarker candidates for Parkinson’s disease

蛋白质组 脑脊液 生物标志物 蛋白质组学 医学 生物标志物发现 神经炎症 疾病 帕金森病 发病机制 生物信息学 病理 生物 免疫学 基因 遗传学
作者
Özge Karayel,Sebastian Virreira Winter,Shalini Padmanabhan,Yuliya I. Kuras,Duc Tung Vu,Idil Tuncali,Kalpana Merchant,Anne‐Marie Wills,Clemens R. Scherzer,Matthias Mann
出处
期刊:Cell reports medicine [Elsevier]
卷期号:3 (6): 100661-100661 被引量:81
标识
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100661
摘要

Summary

Parkinson's disease (PD) is a growing burden worldwide, and there is no reliable biomarker used in clinical routines to date. Cerebrospinal fluid (CSF) is routinely collected in patients with neurological symptoms and should closely reflect alterations in PD patients' brains. Here, we describe a scalable and sensitive mass spectrometry (MS)-based proteomics workflow for CSF proteome profiling. From two independent cohorts with over 200 individuals, our workflow reproducibly quantifies over 1,700 proteins from minimal CSF amounts. Machine learning determines OMD, CD44, VGF, PRL, and MAN2B1 to be altered in PD patients or to significantly correlate with clinical scores. We also uncover signatures of enhanced neuroinflammation in LRRK2 G2019S carriers, as indicated by increased levels of CTSS, PLD4, and HLA proteins. A comparison with our previously acquired urinary proteomes reveals a large overlap in PD-associated changes, including lysosomal proteins, opening up new avenues to improve our understanding of PD pathogenesis.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
1秒前
2秒前
CipherSage应助single采纳,获得10
2秒前
上官若男应助single采纳,获得10
2秒前
科研通AI2S应助月半采纳,获得30
2秒前
cxxxx应助RUI采纳,获得10
2秒前
天南发布了新的文献求助30
2秒前
CipherSage应助碧蓝的含羞草采纳,获得10
3秒前
David完成签到,获得积分10
3秒前
ZZY发布了新的文献求助10
3秒前
Gzl完成签到 ,获得积分10
4秒前
4秒前
hanchangcun发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
zyc发布了新的文献求助10
4秒前
不1mo发布了新的文献求助10
5秒前
momo发布了新的文献求助10
5秒前
David发布了新的文献求助10
5秒前
Redamancy发布了新的文献求助10
6秒前
7秒前
想喝冰美完成签到,获得积分10
8秒前
zhengyuanyuan完成签到,获得积分10
8秒前
今后应助superspace采纳,获得30
8秒前
小核桃完成签到,获得积分10
9秒前
机灵夏云完成签到,获得积分10
9秒前
Biofly526完成签到,获得积分10
9秒前
9秒前
CipherSage应助supermary采纳,获得10
10秒前
wanci应助煜琪采纳,获得10
10秒前
11秒前
华仔应助zyc采纳,获得10
11秒前
冷艳易文完成签到,获得积分10
12秒前
12秒前
华仔应助咩咩采纳,获得10
12秒前
13秒前
ZZY完成签到,获得积分20
13秒前
Redamancy完成签到,获得积分10
13秒前
月月完成签到,获得积分10
13秒前
大力的幻柏完成签到,获得积分10
14秒前
高分求助中
Evolution 10000
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
Diagnostic immunohistochemistry : theranostic and genomic applications 6th Edition 500
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3148361
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2799495
关于积分的说明 7835018
捐赠科研通 2456710
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1307424
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 628154
版权声明 601655