When FLOW-FISH met FACS: Combining multiparametric, dynamic approaches for microbial single-cell research in the total environment

单元格排序 流式细胞术 背景(考古学) 荧光原位杂交 生物 分类 计算生物学 原位 单细胞分析 化学 细胞 生物系统 计算机科学 分子生物学 生物化学 渔业 程序设计语言 染色体 有机化学 古生物学 基因
作者
André C. Pereira,Ana Tenreiro,Mónica V. Cunha
出处
期刊:Science of The Total Environment [Elsevier BV]
卷期号:806: 150682-150682 被引量:18
标识
DOI:10.1016/j.scitotenv.2021.150682
摘要

In environmental microbiology, the ability to assess, in a high-throughput way, single-cells within microbial communities is key to understand their heterogeneity. Fluorescence in situ hybridization (FISH) uses fluorescently labeled oligonucleotide probes to detect, identify, and quantify single cells of specific taxonomic groups. The combination of Flow Cytometry (FLOW) with FISH (FLOW-FISH) enables high-throughput quantification of complex whole cell populations, which when associated with fluorescence-activated cell sorting (FACS) enables sorting of target microorganisms. These sorted cells may be investigated in many ways, for instance opening new avenues for cytomics at a single-cell scale. In this review, an overview of FISH and FLOW methodologies is provided, addressing conventional methods, signal amplification approaches, common fluorophores for cell physiology parameters evaluation, and model variation techniques as well. The coupling of FLOW-FISH-FACS is explored in the context of different downstream applications of sorted cells. Current and emerging applications in environmental microbiology to outline the interactions and processes of complex microbial communities within soil, water, animal microbiota, polymicrobial biofilms, and food samples, are described.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
2秒前
我嘞个豆完成签到,获得积分10
2秒前
爱笑晓曼发布了新的文献求助10
3秒前
wdy111应助sc采纳,获得20
3秒前
敏感初露发布了新的文献求助10
3秒前
隐形曼青应助机智思真采纳,获得10
6秒前
思源应助时尚俊驰采纳,获得10
6秒前
可爱的函函应助敏感初露采纳,获得10
6秒前
7秒前
爆米花应助橙子采纳,获得10
10秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
12秒前
阿满完成签到 ,获得积分10
13秒前
王馨雨完成签到,获得积分10
14秒前
在水一方应助袁涛采纳,获得10
14秒前
爱笑晓曼完成签到,获得积分10
17秒前
18秒前
19秒前
nuoran发布了新的文献求助10
20秒前
20秒前
乐乐宝完成签到,获得积分10
21秒前
22秒前
彭于晏应助阿钉采纳,获得10
23秒前
孙燕应助阿钉采纳,获得10
23秒前
整齐小松鼠应助阿钉采纳,获得10
23秒前
jszhoucl发布了新的文献求助10
24秒前
一定行发布了新的文献求助10
24秒前
jxlu发布了新的文献求助10
25秒前
27秒前
橙子发布了新的文献求助10
27秒前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
李健应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
爆米花应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
乐乐应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
天天快乐应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
28秒前
CipherSage应助科研通管家采纳,获得10
29秒前
科研通AI5应助科研通管家采纳,获得10
29秒前
29秒前
华仔应助科研通管家采纳,获得10
29秒前
29秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
‘Unruly’ Children: Historical Fieldnotes and Learning Morality in a Taiwan Village (New Departures in Anthropology) 400
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
基于可调谐半导体激光吸收光谱技术泄漏气体检测系统的研究 350
Robot-supported joining of reinforcement textiles with one-sided sewing heads 320
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3989378
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3531442
关于积分的说明 11254002
捐赠科研通 3270126
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1804887
邀请新用户注册赠送积分活动 882087
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 809173