Alternative splicing and gene structure of the transforming growth factor β-activated kinase 1

RNA剪接 拼接因子 基因 选择性拼接 转化生长因子 遗传学 细胞生物学 生物 计算生物学 外显子 核糖核酸
作者
Clare Dempsey,Hiroaki Sakurai,Takahisa Sugita,François Guesdon
出处
期刊:Biochimica et biophysica acta (N) [Elsevier]
卷期号:1517 (1): 46-52 被引量:26
标识
DOI:10.1016/s0167-4781(00)00258-x
摘要

We have identified a fourth splice variant of the TGF beta-activated kinase (TAK1), called TAK1-d, and identified an error in the previously published TAK1-c sequence. Our data shows that the c and d variants encode proteins whose carboxyl ends differ markedly from those of variants a and b. Analysis of the human TAK1 gene sequence, located at 6q16.1-q16.3, shows that the coding sequence is organised in 17 exons. The four splice variants result from alternative splicing of exons 12 and 16, the reading frame of exon 17 being determined by the presence or absence of exon 16. Study of the relative levels of expression of the four splice variants showed significant variations between tissues. Our evidence suggests that the alternative splicing of the TAK1 mRNA may have important functional implications.
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