Evolution, genetic recombination, and phylogeography of goose parvovirus

生物 进化生物学 遗传多样性 系统发育树 系统地理学 重组 传输(电信) 遗传分析 系统发育学 水禽 遗传学 基因 生态学 计算机科学 人口 电信 人口学 社会学 栖息地
作者
Xinrui Huo,Yumeng Chen,Jingru Zhu,Yong Wang
出处
期刊:Comparative Immunology Microbiology and Infectious Diseases [Elsevier]
卷期号:102: 102079-102079 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.cimid.2023.102079
摘要

Goose parvovirus (GPV) has garnered global attention due to its association with severe symptoms in waterfowl. However, the process underlying the global emergence and spread of GPV remains largely elusive. In this study, we illustrated the evolutionary characteristics of GPVs from a global perspective using phylogenetic analysis, recombination analysis, selection pressure analysis, and phylogeographic analysis. Our findings indicate that GPV and muscovy duck parvovirus (MDPV) diverge into two distinct branches. Within GPV, there are two classifications: classical GPV (C-GPV) and novel GPV (N-GPV), each containing three subgroups, underscoring the significant genetic diversity of GPV. Recombination analysis revealed 11 recombination events, suggesting C-GPV, N-GPV, and MDPV co-infections. Further, phylogeographic analysis revealed that China is an important exporter of GPV and that trade might serve as a potential transmission conduit. Nonetheless, a detailed understanding of its geographic transmission dynamics warrants further investigation due to the limited scope of current genomic data in our study. This study offers novel insights into the evolutionary state and spread of GPV, holding promise for informing preventive and containment strategies against GPV infection.
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